NICOLAS PALOPOLI

Datos académicos

Lugar de trabajo	UNIVERSIDAD NACIONAL DE QUILMES / CENTRO DE EST.E INVESTIGACION / PROG.SIMULACION DE PROC.MOLECULARES DE RELEVANCIA
Título	Doctor con mención en Ciencias Básicas y Aplicadas
Grado	Universitario de posgrado/doctorado
Campo de aplicación	Promocion general del conocimiento
Especialidad	Bioinformática y Biología Computacional

PRODUCCION CIENTÍFICO TECNOLÓGICA

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Artículo Addressing the role of conformational diversity in protein structure prediction

Palopoli, Nicolás ; Monzón, Alexander ; Parisi, Gustavo Daniel ; Fornasari, Maria Silvina (Public Library of Science, 2016-05)
Artículo BeEP Server: using evolutionary information for quality assessment of protein structure models

Palopoli, Nicolás ; Lanzarotti, Esteban Omar ; Parisi, Gustavo Daniel (Oxford University Press, 2013-07)
Artículo Bioinformatics calls the school: Use of smartphones to introduce python for bioinformatics in high schools

Velez Rueda, Ana Julia ; Benítez, Guillermo Ignacio ; Marchetti, Julia ; Hasenahuer, Marcia Anahí ; Fornasari, Maria Silvina ; Palopoli, Nicolás ; Parisi, Gustavo Daniel (Public Library of Science, 2019-02)
Artículo CaviDB: a database of cavities and their features in the structural and conformational space of proteins

Velez Rueda, Ana Julia ; Bulgarelli, Franco Leonardo; Palopoli, Nicolás ; Parisi, Gustavo Daniel (Oxford University Press, 2023-01)
Artículo CoDNaS-RNA: a database of Conformational Diversity in the Native State of RNA

González Buitrón, Martín ; Romario Tunque Cahui, Ronaldo; García Ríos, Emilio; Hirsh, Layla; Fornasari, Maria Silvina ; Parisi, Gustavo Daniel ; Palopoli, Nicolás (Cold Spring Harbor Laboratory, 2020-10)
Artículo Combining Protein Conformational Diversity and Phylogenetic Information Using CoDNaS and CoDNaS-Q

Escobedo, Nahuel Abel ; Monzon, Alexander Miguel; Fornasari, Maria Silvina ; Palopoli, Nicolás ; Parisi, Gustavo Daniel (John Wiley & Sons Ltd, 2023-05)
Artículo Computational prediction of short linear motifs from protein sequences

Edwards, Richard J.; Palopoli, Nicolás (Springer, 2015-01)
Artículo Critical assessment of protein intrinsic disorder prediction

Necci, Marco; Piovesan, Damiano; Hoque, Md Tamjidul; Walsh, Ian; Iqbal, Sumaiya; Vendruscolo, Michele; Sormanni, Pietro; Wang, Chen; Raimondi, Daniele; Sharma, Ronesh; Zhou, Yaoqi; Litfin, Thomas; Galzitskaya, Oxana Valerianovna; Lobanov, Michail Yu.; Vranken, Wim; Wallner, Björn; Mirabello, Claudio; Malhis, Nawar; Dosztányi, Zsuzsanna; Erdős, Gábor; Mészáros, Bálint; Gao, Jianzhao; Wang, Kui; Hu, Gang; Wu, Zhonghua; Sharma, Alok; Hanson, Jack; Paliwal, Kuldip; Callebaut, Isabelle; Bitard-Feildel, Tristan; Orlando, Gabriele; Peng, Zhenling; Xu, Jinbo; Wang, Sheng; Jones, David T.; Cozzetto, Domenico; Meng, Fanchi; Yan, Jing; Gsponer, Jörg; Cheng, Jianlin; Wu, Tianqi; Kurgan, Lukasz; Promponas, Vasilis J.; Tamana, Stella; Marino, Cristina Ester ; Martinez Perez, Elizabeth ; Chasapi, Anastasia; Ouzounis, Christos; Dunker, A. Keith; Kajava, Andrey V.; Leclercq, Jeremy Y.; Aykac-Fas, Burcu; Lambrughi, Matteo; Maiani, Emiliano; Papaleo, Elena; Chemes, Lucia Beatriz ; Álvarez, Lucía ; González Foutel, Nicolás Sebastián ; Iglesias, Valentin; Pujols, Jordi; Ventura, Salvador; Palopoli, Nicolás ; Benítez, Guillermo Ignacio ; Parisi, Gustavo Daniel ; Bassot, Claudio; Elofsson, Arne; Govindarajan, Sudha; Lamb, John; Salvatore, Marco; Hatos, András; Monzon, Alexander Miguel; Bevilacqua, Martina; Mi?eti?, Ivan; Minervini, Giovanni; Paladin, Lisanna; Quaglia, Federica; Leonardi, Emanuela; Davey, Norman; Horvath, Tamas; Kovacs, Orsolya Panna; Murvai, Nikoletta; Pancsa, Rita; Schad, Eva; Szabo, Beata; Tantos, Agnes; Macedo Ribeiro, Sandra; Manso, Jose Antonio; Pereira, Pedro José Barbosa; Davidović, Radoslav; Veljkovic, Nevena; Hajdu Soltész, Borbála; Pajkos, Mátyás; Szaniszló, Tamás; Guharoy, Mainak; Lazar, Tamas; Macossay Castillo, Mauricio; Tompa, Peter; Tosatto, Silvio C. E. (Nature Publishing Group, 2021-04)
Artículo ELM—the eukaryotic linear motif resource in 2020

Kumar, Manjeet; Gouw, Marc; Michael, Sushama; Sámano-Sánchez, Hugo; Pancsa, Rita; Glavina, Juliana ; Diakogianni, Athina; Valverde, Jesús Alvarado; Bukirova, Dayana; Calyseva, Jelena; Palopoli, Nicolás ; Davey, Norman E.; Chemes, Lucia Beatriz ; Gibson, Toby J (Oxford University Press, 2019-11)
Artículo Evolution of SLiM-mediated hijack functions in intrinsically disordered viral proteins

Glavina, Juliana ; Palopoli, Nicolás ; Chemes, Lucia Beatriz (Journal of the Serbian Chemical Society, 2022-12)
Artículo Evolutionary rates in human amyloid proteins reveal their intrinsic metastability

Zea, Diego Javier ; Mac Donagh, Juan ; Benítez, Guillermo Ignacio ; Guisande Donadio, Cristian Emanuel ; Marchetti, Julia ; Palopoli, Nicolás ; Fornasari, Maria Silvina ; Parisi, Gustavo Daniel (Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2022-09)
Artículo Expanding the repertoire of human tandem repeat RNA-binding proteins

Ormazábal, Agustín ; Carletti, Matías Sebastian ; Saldaño, Tadeo Enrique ; González Buitrón, Martín ; Marchetti, Julia ; Palopoli, Nicolás ; Bateman, Alex (Public Library of Science, 2023-09)
Artículo Highlights of the 1st Argentine Symposium of Young Bioinformatics Researchers (1SAJIB) organized by the ISCB RSG-Argentina

Parra, Rodrigo Gonzalo ; Defelipe, Lucas Alfredo ; Guzovsky, Ana Brenda ; Monzón, Alexander ; Cravero, Fiorella; Mancini, Estefania ; Moreyra, Nicolás Nahuel; Padilla Franzotti, Carla Luciana; Revuelta, María Victoria ; Freiberger, Maria Ines; Gonzalez, Nahuel H.; Gonzalez, German Andres; Orts, Facundo ; Stocchi, Nicolas ; Hasenahuer, Marcia Anahí ; Teppa, Roxana Elin ; Zea, Diego Javier ; Palopoli, Nicolás (PeerJ, 2016-10)
Artículo Impact of protein conformational diversity on AlphaFold predictions

Saldanõ, Tadeo; Escobedo, Nahuel Abel ; Marchetti, Julia ; Zea, Diego Javier ; Mac Donagh, Juan ; Velez Rueda, Ana Julia ; Gonik, Eduardo ; Garcia Melani, Agustina; Novomisky Nechcoff, Julieta; Salas, Nicolás Martín ; Peters, Tomás; Demitroff, Nicolas ; Fernández Alberti, Sebastián ; Palopoli, Nicolás ; Fornasari, Maria Silvina ; Parisi, Gustavo Daniel (Oxford University Press, 2022-05)
Artículo Intrinsically Disordered Protein Ensembles Shape Evolutionary Rates Revealing Conformational Patterns

Palopoli, Nicolás ; Marchetti, Julia ; Monzon, Alexander M.; Zea, Diego J.; Tosatto, Silvio C.E.; Fornasari, Maria Silvina ; Parisi, Gustavo Daniel (Academic Press Ltd - Elsevier Science Ltd, 2021-02-05)
Artículo ISCB-Student Council Narratives: Strategical development of the ISCB-Regional Student Groups in 2016

Shome, Sayane; Meysman, Pieter; Parra, Rodrigo Gonzalo ; Monzón, Alexander ; Palopoli, Nicolás ; White, Benjamen; Rahman, Farzana; Hassan, Mehedi; Özkeserli, Zeynep; Ashano, Efejiro; Hughitt, V. Keith; Uzair Khan, Muhammad; Murphy, Denis J. (Faculty of 1000 Ltd, 2016-12)
Artículo Minimum information guidelines for experiments structurally characterizing intrinsically disordered protein regions

Mészáros, Bálint; Hatos, András; Palopoli, Nicolás ; Quaglia, Federica; Salladini, Edoardo; Van Roey, Kim; Arthanari, Haribabu; Dosztányi, Zsuzsanna; Felli, Isabella C.; Fischer, Patrick D.; Hoch, Jeffrey C.; Jeffries, Cy M.; Longhi, Sonia; Maiani, Emiliano; Orchard, Sandra; Pancsa, Rita; Papaleo, Elena; Pierattelli, Roberta; Piovesan, Damiano; Pritisanac, Iva; Tenorio, Luiggi; Viennet, Thibault; Tompa, Peter; Vranken, Wim; Tosatto, Silvio C. E.; Davey, Norman E. (Nature Publishing Group, 2023-07)
Artículo Protein conformational diversity modulates sequence divergence

Juritz, Ezequiel ; Fernández Alberti, Sebastián ; Palopoli, Nicolás ; Fornasari, Maria Silvina ; Parisi, Gustavo Daniel (Oxford University Press, 2012-03)
Artículo "Protein" no longer means what it used to

Parisi, Gustavo Daniel ; Palopoli, Nicolás ; Tosatto, Silvio C. E.; Fornasari, Maria Silvina ; Tompa, Peter (Elsevier, 2021-06)
Artículo ProtMiscuity: a database of promiscuous proteins

Velez Rueda, Ana Julia ; Palopoli, Nicolás ; Zacarías, Matías; Sommese, Leandro Matías ; Parisi, Gustavo Daniel (Oxford University Press, 2019-01)

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