Creating 2D Occupancy Plots Using plot2DO

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dc.conicet.fuenteindividual
dc.conicet.organizacionConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"
dc.conicet.organizacionNational Institutes of Health
dc.conicet.paisOrganizacionArgentina
dc.conicet.paisOrganizacionEstados Unidos
dc.conicet.produccionid9775923
dc.conicet.rolAutor
dc.conicet.rolAutor
dc.contributor.authorBeati, Maria Paula
dc.contributor.authorChereji, Razvan V.
dc.coverageInternacional
dc.date.accessioned2023-06-26T10:40:57Z
dc.date.available2023-06-26T10:40:57Z
dc.date.evento2020-07-27
dc.date.eventoHasta2020-07-31
dc.date.issued2020es
dc.date.updated2022-11-01T23:02:59Z
dc.description.abstractThe 2D occupancy (2DO) plot is useful for an initial quality check of MNase-seq data, in order to assess the degree of chromatin digestion, and also for getting insights about the nucleosome organization, as well as about the MNase digestion kinetics.plot2DO is a flexible tool for evaluating the quality of MNase-seq and MNase-ChIP-seq data, and for visualizing the distribution of nucleosomes near the functional regions of the genome.es
dc.description.ciudadEventoBostones
dc.description.filFil: Beati, Maria Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
dc.description.filFil: Chereji, Razvan V.. National Institutes of Health; Estados Unidos
dc.description.institucionOrganizadoraBioconductor Comité Organizadores
dc.description.nombreEventoBioC 2020: Where Software and Biology Connectes
dc.description.paisEventoEstados Unidoses
dc.formatapplication/pdfes
dc.identifier.citationCreating 2D Occupancy Plots Using plot2DO; BioC 2020: Where Software and Biology Connect; Boston; Estados Unidos; 2020; 1-8es
dc.identifier.institucionalCONICET
dc.identifier.issn2046-1402es
dc.identifier.repoCONICET Digital
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11336/201398
dc.journal.ciudadLondreses
dc.journal.pagination1-8es
dc.journal.paisReino Unidoes
dc.language.isoenges
dc.publisherF1000Researches
dc.relation.alternativeidinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.7490/f1000research.1118043.1
dc.relation.alternativeidinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://f1000research.com/slides/9-724
dc.relation.alternativeidinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://bioc2020.bioconductor.org/
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess*
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/*
dc.source.revistaF1000Researches
dc.subjectMNaseSeqes
dc.subjectNucleosomePositioninges
dc.subjectVisualizationes
dc.subjectSoftwarees
dc.subject.classificationOtros Tópicos Biológicoses
dc.subject.classificationCiencias Biológicases
dc.subject.classificationCIENCIAS NATURALES Y EXACTASes
dc.titleCreating 2D Occupancy Plots Using plot2DOes
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/conferenceObject
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/documento de conferencia
dc.type.publicacionJournales
dc.type.subtypeConferenciaes

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