Bammds: a tool for assessing the ancestry of low-depth whole-genome data using multidimensional scaling (MDS)

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dc.conicet.fuenteindividual
dc.conicet.organizacionUniversidad de Copenhagen
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dc.conicet.organizacionUniversidad de Copenhagen
dc.conicet.organizacionUniversidad de Copenhagen
dc.conicet.organizacionPennsylvania State University
dc.conicet.organizacionUniversity of California
dc.conicet.organizacionUniversidad de Copenhagen
dc.conicet.organizacionConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Investigaciones Arqueológicas y Paleontológicas del Cuaternario Pampeano. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Investigaciones Arqueológicas y Paleontológicas del Cuaternario Pampeano
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dc.conicet.paisOrganizacionArgentina
dc.conicet.paisOrganizacionDinamarca
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dc.conicet.produccionid7856828
dc.contributor.authorMalaspinas, Anna Sapfo
dc.contributor.authorTange, Ole
dc.contributor.authorMoreno Mayar, José Víctor
dc.contributor.authorRasmussen, Morten
dc.contributor.authorDeGiorgio, Michael
dc.contributor.authorWang, Yong
dc.contributor.authorValdiosera, Cristina E.
dc.contributor.authorPolitis, Gustavo Gabriel
dc.contributor.authorWillerslev, Eske
dc.contributor.authorNielsen, Rasmus
dc.date.accessioned2021-07-22T18:38:12Z
dc.date.available2021-07-22T18:38:12Z
dc.date.issued2014-10
dc.date.updated2020-12-22T15:48:06Z
dc.description.abstractSUMMARY: We present bammds, a practical tool that allows visualization of samples sequenced by second-generation sequencing when compared with a reference panel of individuals (usually genotypes) using a multidimensional scaling algorithm. Our tool is aimed at determining the ancestry of unknown samples-typical of ancient DNA data-particularly when only low amounts of data are available for those samples.es
dc.description.filFil: Malaspinas, Anna Sapfo. Universidad de Copenhagen; Dinamarca
dc.description.filFil: Tange, Ole. Universidad de Copenhagen; Dinamarca
dc.description.filFil: Moreno Mayar, José Víctor. Universidad de Copenhagen; Dinamarca
dc.description.filFil: Rasmussen, Morten. Universidad de Copenhagen; Dinamarca
dc.description.filFil: DeGiorgio, Michael. Pennsylvania State University; Estados Unidos
dc.description.filFil: Wang, Yong. University of California; Estados Unidos
dc.description.filFil: Valdiosera, Cristina E.. Universidad de Copenhagen; Dinamarca
dc.description.filFil: Politis, Gustavo Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Investigaciones Arqueológicas y Paleontológicas del Cuaternario Pampeano. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Investigaciones Arqueológicas y Paleontológicas del Cuaternario Pampeano; Argentina
dc.description.filFil: Willerslev, Eske. Universidad de Copenhagen; Dinamarca
dc.description.filFil: Nielsen, Rasmus. Universidad de Copenhagen; Dinamarca
dc.formatapplication/pdfes
dc.identifier.citationMalaspinas, Anna Sapfo; Tange, Ole; Moreno Mayar, José Víctor; Rasmussen, Morten; DeGiorgio, Michael; et al.; Bammds: a tool for assessing the ancestry of low-depth whole-genome data using multidimensional scaling (MDS); Oxford University Press; Bioinformatics (Oxford, England); 30; 20; 10-2014; 2962-2964es
dc.identifier.institucionalCONICET
dc.identifier.issn1367-4811es
dc.identifier.repoCONICET Digital
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11336/136694
dc.journal.ciudadOxfordes
dc.journal.number20es
dc.journal.pagination2962-2964es
dc.journal.paisReino Unidoes
dc.journal.titleBioinformatics (Oxford, England)es
dc.journal.volume30es
dc.language.isoenges
dc.publisherOxford University Presses
dc.relation.alternativeidinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btu410
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess*
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/*
dc.subjectANCESTROSes
dc.subjectGENETICes
dc.subjectDNAes
dc.subject.classificationArqueologíaes
dc.subject.classificationHistoria y Arqueologíaes
dc.subject.classificationHUMANIDADESes
dc.titleBammds: a tool for assessing the ancestry of low-depth whole-genome data using multidimensional scaling (MDS)es
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/artículo
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion

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