Artículo

Bammds: a tool for assessing the ancestry of low-depth whole-genome data using multidimensional scaling (MDS)

 Malaspinas, Anna Sapfo ; Tange, Ole ; Moreno Mayar, José Víctor ; Rasmussen, Morten ; DeGiorgio, Michael ; Wang, Yong ; Valdiosera, Cristina E. ; Politis, Gustavo Gabriel Icon; Willerslev, Eske ; Nielsen, Rasmus

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Fecha

10/2014

Editorial

Oxford University Press

Revista

Bioinformatics (Oxford, England)

Título del libro

Nombre del evento

Fecha del evento

Institución organizadora

ISSN

1367-4811

eISSN

ISBN

Idioma

Inglés

Tipo del evento

Clasificación temática

Arqueología

Palabras clave

ANCESTROS , GENETIC , DNA

Resumen

SUMMARY: We present bammds, a practical tool that allows visualization of samples sequenced by second-generation sequencing when compared with a reference panel of individuals (usually genotypes) using a multidimensional scaling algorithm. Our tool is aimed at determining the ancestry of unknown samples-typical of ancient DNA data-particularly when only low amounts of data are available for those samples.

URI

http://hdl.handle.net/11336/136694

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Identificadores
URI: http://hdl.handle.net/11336/136694
DOI: http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btu410
Citación
Malaspinas, Anna Sapfo; Tange, Ole; Moreno Mayar, José Víctor; Rasmussen, Morten; DeGiorgio, Michael; et al.; Bammds: a tool for assessing the ancestry of low-depth whole-genome data using multidimensional scaling (MDS); Oxford University Press; Bioinformatics (Oxford, England); 30; 20; 10-2014; 2962-2964
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