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Artículo

Genetic algorithm applied to simultaneous parameter estimation in bacterial growth

Pedrozo, Hector AlejandroIcon ; Dallagnol, Andrea MicaelaIcon ; Schvezov, Carlos EnriqueIcon
Fecha de publicación: 11/2020
Editorial: World Scientific
Revista: Journal of Bioinformatics and Computational Biology
ISSN: 0219-7200
e-ISSN: 1757-6334
Idioma: Inglés
Tipo de recurso: Artículo publicado
Clasificación temática:
Otras Ciencias Naturales y Exactas

Resumen

Several mathematical models have been developed to understand the interactions ofmicroorganisms in foods and predict their growth. The resulting model equations forthe growth of interacting cells include several parameters that must be determined forthe specific conditions to be modeled. In the present report, these parameters weredetermined by using inverse engineering and a multi-objective optimization procedurethat allows fitting more than one experimental growth curve simultaneously. A geneticalgorithm was applied to obtain the best parameter values of a model that permit theconstruction of the front of Pareto with 50 individuals or phenotypes. The method wasapplied to three experimental data sets of simultaneous growth of lactic acid bacteria(LAB) and Listeria monocytogenes (LM). Then, the proposed method was comparedwith a conventional mono-objective sequential fit. We concluded that the multiobjectivefit by the genetic algorithm gives superior results with more parameteridentifiability than the conventional sequential approach.
Palabras clave: PREDICTIVE MICROBIOLOGY , BACTERIAL INTERACTIONS , PARAMETER ESTIMATION , GENETIC ALGORITHM
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info:eu-repo/semantics/restrictedAccess Excepto donde se diga explícitamente, este item se publica bajo la siguiente descripción: Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 2.5 Unported (CC BY-NC-SA 2.5)
Identificadores
URI: http://hdl.handle.net/11336/120102
URL: https://www.worldscientific.com/doi/abs/10.1142/S0219720020500456
DOI: http://dx.doi.org/10.1142/S0219720020500456
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Citación
Pedrozo, Hector Alejandro; Dallagnol, Andrea Micaela; Schvezov, Carlos Enrique; Genetic algorithm applied to simultaneous parameter estimation in bacterial growth; World Scientific; Journal of Bioinformatics and Computational Biology; 11-2020; 1-21
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