R code for analyzing functional diversity (FRic) and phylogenetic diversity (PD) in Andean rodents
; Vicenzi, Nadia Pamela Otros responsables
Fecha
Publicador:
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
Fecha de depósito:
2/09/2026
Fecha de creación:
15/4/2026
Clasificación temática
Palabras clave
Resumen
This repository contains the R code used to analyze functional diversity and alpha phylogenetic diversity in Andean rodent communities. The script includes the calculation of Faith's PD, FRic, MPD, and F_MPD, based on ecological/morphological traits and species phylogeny, as well as their corresponding standardized effect sizes (SES), obtained through comparison with null models. The code allows for reproduction of the analyses and results presented in the associated manuscript.
Métodos
Este repositorio contiene el código en R utilizado para analizar la diversidad funcional y la diversidad filogenética alfa en comunidades de roedores de los Andes. El script incluye el cálculo de PD de Faith (riqueza filogenética), FRic (riqueza funcional), MPD (distancia media entre pares) y F_MPD (distancia media entre pares funcional), a partir de rasgos ecológicos/morfológicos y de la filogenia de las especies, así como sus correspondientes tamaños de efecto estandarizados (SES, standardized effect sizes), obtenidos por comparación con modelos nulos. El código permite reproducir los análisis y resultados presentados en el manuscrito asociado.
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