Análisis de variantes genéticas en pacientes con Síndrome Polipósico Hereditario de Argentina y Chile: identificación de 4 alteraciones no descriptas

Abstract

Examinamos genes asociados al desarrollo desíndromes polipósicos hereditarios (poliposisadenomatosa familiar (PAF) y hamartomatosa), afin de identificar alteraciones genéticas causales deenfermedad en 81 casos afectados no relacionadosde Argentina (Arg) y Chile (Chi). Utilizando unacombinación de secuenciación exómica completa(WES) y MLPA para grandes rearreglos, se identificóla alteración específica en 40,7% (33/81) de los casosanalizados. Se detectaron 27 variantes en el gen APC,3 en MUTYH, 2 en SMAD4 y 1 en POLE. Un 50% de lasvariantes fueron clasificadas clínicamente comoPatogénicas (Clase 5) y el otro 50% como variantesde significado incierto (VUS, Clase 3). Se identificaron4 variantes no descriptas a nivel germinal, 3 en APC(NM_000038.6): c.1271dupA (p.E425Gfs*4), Arg;c.532T>A (p.F178I), Chi; c.4948A>T (p.N1650Y), Chi; y1 en SMAD4 (NM_005359.5): c.742C>T (p.Q248*), Arg.Para MUTYH (NM_001128425.1) 2/3 casos presentaron2 SNVs patogénicos en estado de heterocigosiscompuesta: c.289C>T (p.R97*) / c.1227_1228dupGG(p.E410Gfs*), Arg; c.536A>G (p.Y179C) / c.1187G>A(p.G396D), Chi. El tercer caso presentó un SNV enhomocigosis, c.1187G>A (p.G396D) [Arg]. En la totalidadde casos la clínica del paciente se correlacionó con laalteración genética identificada. En particular para APC,el presente estudio amplía el espectro de alteraciones,y refuerza el concepto de heterogeneidad de variantescausales para el gen. Nuestros datos confirman que lacorrelación genotipo/fenotipo en pacientes argentinosy chilenos es similar a la observada en otras poblaciones.