INSECT 2.0: A web-server for genome-wide cis-regulatory modules prediction

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dc.conicet.fuenteCrossref
dc.conicet.organizacionUniversidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
dc.conicet.organizacionConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
dc.conicet.organizacionUniversidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
dc.conicet.organizacionConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
dc.conicet.organizacionConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck
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dc.conicet.paisOrganizacionArgentina
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dc.conicet.produccionid6821763
dc.contributor.authorParra, Rodrigo Gonzalo
dc.contributor.authorRohr, Cristian Oscar
dc.contributor.authorKoile, Daniel Isaac
dc.contributor.authorPerez Castro, Carolina Ines
dc.contributor.authorYankilevich, Patricio
dc.date.accessioned2018-03-06T18:14:45Z
dc.date.available2018-03-06T18:14:45Z
dc.date.issued2016-04
dc.date.updated2018-03-05T20:44:50Z
dc.description.abstractINSECT is a user-friendly web server to predict the occurrence of Cis-Regulatory Modules (CRMs), which control gene expression. Here, we present a new release of INSECT which includes several new features, such as whole genome analysis, nucleosome occupancy predictions, and which provides additional links to third-party functional tools that complement user capabilities, CRM analysis and hypothesis construction. Improvements in the core implementation have led to a faster and more efficient tool. In addition, this new release introduces a new interface designed for a more integrative and dynamic user experience.es
dc.description.filFil: Parra, Rodrigo Gonzalo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.filFil: Rohr, Cristian Oscar. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.filFil: Koile, Daniel Isaac. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; Argentina
dc.description.filFil: Perez Castro, Carolina Ines. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; Argentina
dc.description.filFil: Yankilevich, Patricio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; Argentina
dc.formatapplication/pdfes
dc.identifier.citationParra, Rodrigo Gonzalo; Rohr, Cristian Oscar; Koile, Daniel Isaac; Perez Castro, Carolina Ines; Yankilevich, Patricio; INSECT 2.0: A web-server for genome-wide cis-regulatory modules prediction; Oxford University Press; Bioinformatics (Oxford, England); 32; 8; 4-2016; 1229-1231es
dc.identifier.institucionalCONICET
dc.identifier.issn1367-4803es
dc.identifier.repoCONICET Digital
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11336/37980
dc.journal.ciudadOxfordes
dc.journal.number8es
dc.journal.pagination1229-1231es
dc.journal.paisReino Unidoes
dc.journal.titleBioinformatics (Oxford, England)es
dc.journal.volume32es
dc.language.isoenges
dc.publisherOxford University Presses
dc.relation.alternativeidinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btv726
dc.relation.alternativeidinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://academic.oup.com/bioinformatics/article/32/8/1229/1744281
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess*
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/*
dc.subjectBioinformaticses
dc.subjectCrmses
dc.subjectInsectes
dc.subjectGene Expressiones
dc.subject.classificationCiencias de la Computaciónes
dc.subject.classificationCiencias de la Computación e Informaciónes
dc.subject.classificationCIENCIAS NATURALES Y EXACTASes
dc.subject.classificationOtras Ciencias Biológicases
dc.subject.classificationCiencias Biológicases
dc.subject.classificationCIENCIAS NATURALES Y EXACTASes
dc.titleINSECT 2.0: A web-server for genome-wide cis-regulatory modules predictiones
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/artículo
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion

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