SARS-CoV-2 in dogs: Gamma variant and its transmission from humans in Ciudad de Buenos Aires, Argentina

Abstract

Este trabajo explora la infección por SARS-CoV-2 en perros que han tenido contacto estrecho con personas diagnosticadas de COVID en Argentina. La identificación molecular del virus fue realizada por RT-PCR a partir de hisopado orofaríngeo y rectal (perro) o nasal (humano). En el caso del perro, el resultado positivo fue confirmado por LAMP/CRISPR y por PCR en tiempo real. A partir del ARN recuperado de las muestras se realizó un análisis parcial de la secuencia de la proteína de la espícula (del aminoácido 428 al 750) que permitió clasificar a ambos genomas virales como variante Gamma, con una única variación a nivel del residuo 726. Se evaluó la respuesta de anticuerpos del perro por ELISA indirecto a través de la prueba argentina COVID AR IgG ELISA adaptada para perros, y también a través de la prueba de pseudoneutralización con pseudotipos de SARS-CoV-2. Además, se evaluó la respuesta celular del perro mediante la prueba de linfoproliferación, con proteína de la espícula como estímulo. A partir de las evidencias encontradas, indicativas de la transmisión humano-perro del SARS-CoV-2 en Argentina, se destaca la importancia del enfoque de Una Salud y de la incorporación de medidas de vigilancia epidemiológica en mascotas en el abordaje de esta infección.This article explores SARS-CoV-2 infection in dogs that have had close contact with humans diagnosed with COVID in Argentina. Affirmative molecular identification of the virus was achieved through RT-PCR analysis of oropharyngeal and rectal swabs from the dog as well as a nasal swab from the guardian. Positive results for the dog were confirmed through a LAMP/CRISPR assay and real time PCR. SARS-CoV-2 genomic RNA was successfully obtained from these samples, and the analysis of a partial sequence of the spike gene (ranging from amino acid 428 to 750) allowed us to classify both genomic sequences as Gamma variants, with a single amino acid variation in position 726. We evaluated the specific humoral immune response of the dog by an indirect ELISA using the Argentinian kit COVID AR IgG ELISA test adapted for domestic dogs, and pseudo-neutralization conducted with SARS-CoV-2 pseudotyped particles. We also evaluated the specific cellular immune response of the dog through a lymphoproliferation assay, using purified spike protein as specific stimulus. This work provides evidence of the human-to-dog transmission of SARS-CoV-2 in Argentina, underscoring the One Health concept and reinforcing surveillance methods in pets.