Next-generation phenotyping in plants: old problems, new promises

Abstract

Current progress in DNA sequencing technology has enabled to gather a large amount of genomic information. Genotyping has become a routine activity with lower costs as new technology emerges. However, genomic information cannot provide much insight into how a given genotype performs. In fact, improvement in understanding phenotypes and the ability to generate good phenotypic data became essential for better utilization of genotypic data and understanding the effect of environment. In this post-genomic era, phenomics emerge as a new discipline that aims the acquisition of high-throughput phenotypic information at all levels of biological organization integrating different “omics” data. New technology in plant phenotyping comprises a wide range of complexity including image analyzing softwares, large-scale platforms and fieldphenotyping systems. The increasingly number of tools for accurate phenotyping as well as the advantages and opportunities for plant sciences are being discussedLos rápidos avances en la tecnología de secuenciación de ADN han permitido obtener una gran cantidad de información a nivel genómico. Actualmente, el principal interés se ha desplazado hacia el estudio del fenotipo con la expectativa de que los progresos en los sistemas de fenotipado puedan aumentar nuestro conocimiento de las relaciones genotipo-fenotipo-ambiente. En esta era post-genómica, la fenómica emerge como una nueva disciplina que integra las demás “ómicas” y busca la adquisición de información en todos los niveles de la organización biológica. En este sentido, las nuevas tecnologías abarcan un amplio rango de complejidad incluyendo programas para el análisis digital de imágenes, plataformas de fenotipado a gran escala y sistemas de fenotipado a campo. En el presente trabajo se discute la importancia de contar con herramientas para la determinación precisa de fenotipos y las oportunidades que las mismas ofrecen para el mejoramiento vegetal