The Phylogenetic Data Matrices of Abelisauridae through Time and Methods (With Recommendations)

Abstract

The phylogenetic history of Abelisauridae has been reconstructed using an increasing number of taxa and different data matrices, many of which are derived from common sources. Despite this, the group still presents notable topological instability. Here, we systematically revise the 40 years of phylogenetic studies on Abelisauridae. We aimed to reconstruct a timeline of matrix iterations to address five key questions: 1) How the abelisaurid phylogenetic matrices changed over time in terms of character and taxon numbers; 2) How many authors have employed differential character weighting in their analyses; 3) What type of characters (e.g., discrete, continuous) have been used in the matrices; 4) What types of calibration methods have been used; and 5) Which were the main goals of these studies. Additionally, we provide recommendations for phylogenetic tree search strategies, time-calibration procedures, character weighting approaches, and the selection and use of data matrices. By synthesizing historical trends and current practices, our work highlights key limitations in the study of the abelisaurid relationships and suggests methodological improvements to strengthen future phylogenetic and macroevolutionary inferences in this clade.La historia filogenética de Abelisauridae ha sido construida utilizando un número creciente de taxones y matrices de datos, muchas de ellas derivadas de fuentes compartidas. A pesar de ello, el grupo aún presenta una notable inestabilidad topológica con análisis filogenéticos bajo similares enfoques. En este trabajo, realizamos una búsqueda bibliográfica que abarca los 40 años de estudios filogenéticos sobre Abelisauridae. Nuestro objetivo fue reconstruir una línea de tiempo del desarrollo de las matrices para abordar cinco preguntas clave: 1) ¿Cómo han cambiado las matrices filogenéticas de Abelisauridae a lo largo del tiempo en términos de número de caracteres y taxones? 2) ¿Cuántos autores han empleado ponderación de caracteres en sus análisis? 3) ¿Qué tipo de caracteres (discretos o continuos) se han utilizado en las matrices? 4) ¿Qué tipos de métodos de calibración temporal se han aplicado? 5) ¿Cuál fue el objetivo principal de estos estudios? Además, proporcionamos recomendaciones sobre estrategias de búsqueda filogenética, procedimientos de calibración temporal, enfoques de ponderación de caracteres, y la selección y uso de matrices de datos. Al sintetizar las tendencias históricas y las prácticas actuales, nuestro trabajo destaca limitaciones clave en el estudio de las relaciones dentro de Abelisauridae y sugiere mejoras metodológicas para fortalecer futuras inferencias filogenéticas y macroevolutivas en este clado.