Analysis of sequence configurations of the PKR-interacting HCV proteins from plasma and PBMC as predictors of response to interferon-alpha and ribavirin therapy in HIV-coinfected patients

Abstract

Antecedentes: El tratamiento basado en interferon es una terapia estándar contra la hepatitis C crónica en pacientes coinfectados con el VIH. Exploramos el rol de dos regiones genómicas del HCV en la respuesta al IFN entre los pacientes coinfectados HIV-HCV. A través de una cohorte homogénea retrospectiva, evaluamos la frecuencia de las mutaciones E2 y NS5A en pacientes con y sin respuesta viral sostenia a la terapia basada en IFN. Métodos: Se individualizaron restrospectivamente las muestras de una cohorte homogenea de 10 pacientes coinfectados con HCV-VIH que completaron la terapia con IFN. Todos los pacientes estaban bajo tratamiento con la terapia HAART. El genotipo del HCV (basado en 5?NCR+NS5B relacionado filogenéticamente) y los análisis genómicos E2/NS5A se realizaron en compartimentos con muestras de suero y PBMC. Se analizaron las mutaciones carboxiterminales de E2, incluyendo el dominio homólogo de fosforilación PKR/eIF2alfa (PePhD) y las mutaciones de dominio unidas a la proteina kinasa de 5A no estructurado (PKRBD). Resultados: Cuatro pacientes lograron una respuesta viral sostenida y 6 fueron no respondedores (NR). Entre los pacientes con respuesta viral sostenida, los genotipos eran Gt-1 (n=3) y Gt4 (n=1). Los tratamientos fallados fueron infectados con el Gt-1 (n=5) y el Gt-2 (n=1). La distribución genotípica fue igual para ambos grupos, los que obtuvieron respuesta viral sostenida y los no respondedores (p>0.05). Entre los compartimentos, el número de mutaciones en PKRBD fue conservado, mientras que el número de mutaciones de dominio PePHD fueron significativamente menores. Los pacientes NR exhibieron casi el mismo número de mutaciones en ambos compartimentos, mientras que aquellos con respuesta viral sostenida solo demostraron mutaciones en aislados del HCV en plasma. Cuando se realizó una comparación entre pacientes, la distribución de mutación cuantitativa o cualitativa entre los compartimentos de plasma y PBMC de cada región genómica se halló que era casi similar. Conclusiones: La frecuencia de mutaciones en las regiones definidas de la envoltura 2 del HCV PePHD y la proteina 5A no estructurada (NS5A) parece no influenciar la capacidad de IFN-alfa para bloquear la replicación del HCV ni tampoco predecir fehacientemente el resultado del tratamiento en pacientes coinfectados con VIH/HCV.