Secuencias fúngicas edáficas obtenidas desde la rizósfera de plantas de yerba mate del sitio UNESCO, Parque Nacional Iguazú como parte del perfilado de comunidades fúngicas edáficas
Otros responsables
Fecha
Publicador:
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
Fecha de depósito:
30/06/2025
Fecha de creación:
10/10/2019-10/12/2023
Clasificación temática
Palabras clave
Resumen
En el marco del Doctorado de Ciencias Aplicadas de la Universidad Nacional de Misiones, se obtuvieron muestras de ADN total de suelo rizosférico de plantas de yerba mate (Ilex paraguariensis) de la zonas buffers del Parque Nacional iguazú, y se secuenciaron gracias a los Doctores Matheus Malewski -Muzeum i Instytut Zoologii PAN, Museum and Institute of Zoology, Polish Academy of Sciences- y Thomas Ozsacko-Instytut Badawczy Leśnictwa, Forest Research Institute, https://www.ibles.pl-.
Estas muestras fueron utilizadas como parte de la metodología de perfilado de comunidades que caracterizaron tres sitios y ciclos de muestreo en la zona mencionada y que, junto a técnicas morfológicas, y fueron analizadas estadísticamente con métodos multivariados.
Estas secuencias fueron reportadas en GenBank en octubre de 2021 y junto a datos de identificación morfológica por disoluciones seriadas realizadas gracias a la Dra. María Isabel Fonseca -Instituto de Biotecnología de Misiones, Universidad Nacional de Misiones-, permitieron proponer un perfil de géneros que componen tres sitios y ciclos de muestreo de suelo rizosférico en el municipio de Comandante Andresito, Misiones.
A continuación, se coloca la descripción de las secuencias en formato FASTA para su identificación en NCBI (National Center for Biotechnology Information ) cuya identificación fue realizada con la herramienta BLAST (Identidad: 100%, valores E: 0) y los resultados exploratorios del perfil a través de métodos multivariados, con la combinación de la identificación morfológica, caracterizando sitios y ciclos de muestreo. Los sitios se fueron identificados en el análisis 1, 2, y 3 (Sitio 1: 25°39'57"S, 54°04'24"O, Sitio 2: 25°32'16"S, 54°08'40"O, Sitio 3 25°32'17"S, 54°08'38"O). Los ciclos de muestreo fueron identificados como 19: 2019-2020; 21: 2021-2022; 23: 2022-2023.
Finalmente, se destaca reporte de una especie por primera vez en la zona muestreada y se incluyen prospecciones futuras don datos metagenómicos.
Información Técnica
Este conjunto de secuencias nucleotídicas fúngicas fueron obtenidas a partir de muestras rizosféricas asociadas a plantas de yerba mate (Ilex paraguariensis) recolectadas en el Parque Nacional Iguazú, un área protegida y reconocida como sitio Patrimonio Mundial de la UNESCO. Las secuencias fueron amplificadas utilizando los cebadores ITS1 e ITS4, que abarcan la región del espaciador interno transcrito (ITS) del ADN ribosomal, ampliamente empleada en estudios de identificación fúngica por su alta resolución taxonómica. La identificación molecular se realizó mediante herramientas de alineamiento, considerando únicamente aquellas secuencias que mostraron una similitud igual o superior al 97% con secuencias de referencia y un valor e=0, lo que garantiza una alta confiabilidad en la asignación taxonómica. Esta información contribuye al conocimiento de la diversidad fúngica edáfica en ecosistemas subtropicales conservados y con alto valor ecológico y biocultural.
Nucleotide sequences of soil fungi identified in the rhizosphere of Ilex paraguariensis in Iguazú National Park (UNESCO Site), with ≥97% similarity and e-value = 0 using the ITS1–ITS4 region
This set of fungal nucleotide sequences was obtained from rhizospheric samples associated with yerba mate (Ilex paraguariensis) plants collected in Iguazú National Park, a protected area recognized as a UNESCO World Heritage Site. The sequences were amplified using the ITS1 and ITS4 primers, which target the internal transcribed spacer (ITS) region of ribosomal DNA—widely used in fungal identification studies due to its high taxonomic resolution. Molecular identification was performed using alignment tools, considering only those sequences that showed ≥97% similarity to reference sequences and an e-value of 0, ensuring high reliability in taxonomic assignment. This information contributes to the understanding of soil fungal diversity in conserved subtropical ecosystems with high ecological and biocultural value.
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