Identification of CfiA coding genes in Bacteroides fragilis isolates recovered in Argentina. Inconsistencies in CfiA organization and nomenclature

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dc.conicet.fuenteindividual
dc.conicet.organizacionGobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"
dc.conicet.organizacionUniversidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica
dc.conicet.organizacionConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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dc.conicet.organizacionUniversidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica
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dc.conicet.paisOrganizacionArgentina
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dc.conicet.produccionid7256311
dc.contributor.authorLitterio, Mirta R.
dc.contributor.authorCejas, Daniela
dc.contributor.authorGutkind, Gabriel Osvaldo
dc.contributor.authorRadice, Marcela Alejandra
dc.date.accessioned2018-09-11T18:19:34Z
dc.date.available2018-09-11T18:19:34Z
dc.date.issued2017-12
dc.date.updated2018-09-11T14:46:58Z
dc.description.abstractCfiA (CcrA) metallo-β-lactamase is the main carbapenem resistance mechanism in B. fragilis. From cfiA positive isolates detected in a previous surveillance study, 3 displayed resistance to imipenem while the remaining were susceptible. The aim of this study was to identify the cfiA alleles and to analyze the presence of IS elements in their upstream regions. CfiA-1, CfiA-4, CfiA-13, CfiA-19 and CfiA-22 were detected. IS elements belonging to IS21 family and IS942 group were identified upstream to cfiA in the 3 imipenem resistant isolates. We present an exhaustive analysis of cfiA/CfiA registers in databases, illustrating the inconsistencies in both organization and nomenclature. According to this analysis CfiA family comprises nowadays 15 different CfiA variants coded by 24 cfiA sequences. Curation of CfiA database is mandatory, if not new cfiA admission at GenBank will contribute to make this classification more complex.es
dc.description.filFil: Litterio, Mirta R.. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; Argentina
dc.description.filFil: Cejas, Daniela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.filFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina
dc.description.filFil: Radice, Marcela Alejandra. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.formatapplication/pdfes
dc.identifier.citationLitterio, Mirta R.; Cejas, Daniela; Gutkind, Gabriel Osvaldo; Radice, Marcela Alejandra; Identification of CfiA coding genes in Bacteroides fragilis isolates recovered in Argentina. Inconsistencies in CfiA organization and nomenclature; Elsevier; Anaerobe; 48; 12-2017; 257-261es
dc.identifier.institucionalCONICET
dc.identifier.issn1075-9964es
dc.identifier.repoCONICET Digital
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11336/59138
dc.journal.ciudadAmsterdames
dc.journal.pagination257-261es
dc.journal.paisPaíses Bajoses
dc.journal.titleAnaerobees
dc.journal.volume48es
dc.language.isoenges
dc.publisherElsevieres
dc.relation.alternativeidinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1016/j.anaerobe.2017.10.003
dc.relation.alternativeidinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1075996417301981
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess*
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/*
dc.subjectBacteroides Fragilises
dc.subjectCarbapenem Resistancees
dc.subjectCfia Metallo-Β-Lactamasees
dc.subject.classificationOtras Ciencias de la Saludes
dc.subject.classificationCiencias de la Saludes
dc.subject.classificationCIENCIAS MÉDICAS Y DE LA SALUDes
dc.titleIdentification of CfiA coding genes in Bacteroides fragilis isolates recovered in Argentina. Inconsistencies in CfiA organization and nomenclaturees
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/artículo
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion

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