Propuesta de Análisis multivariado exploratorio en los niveles Alfa, Beta y Gamma de la diversidad del microbioma rizosférico de Ilex paraguariensis

Abstract

En el marco del Doctorado de Ciencias Aplicadas de la Universidad Nacional de Misiones, se obtuvieron muestras de ADN total de suelo rizosférico de plantas de yerba mate (Ilex paraguariensis) de las zonas buffers del Parque Nacional iguazú, y se secuenciaron gracias a los Doctores Matheus Malewski -Muzeum i Instytut Zoologii PAN, Museum and Institute of Zoology, Polish Academy of Sciences- y Thomas Ozsacko-Instytut Badawczy Leśnictwa, Forest Research Institute, https://www.ibles.pl-. Estas muestras fueron utilizadas como parte de la metodología de perfilado de comunidades que caracterizaron tres sitios y ciclos de muestreo en la zona mencionada y que, junto a técnicas morfológicas, fueron analizadas con métodos multivariados. Estas secuencias fueron reportadas en GenBank en octubre de 2021 y junto a datos de identificación morfológica por disoluciones seriadas realizadas gracias a la supervisión de los Dres. Gustavo Bich y Lorena Castrillo -Instituto de Biotecnología de Misiones, Universidad Nacional de Misiones-, permitieron proponer un perfil de géneros que componen tres sitios y ciclos de muestreo de suelo rizosférico en el Municipio de Comandante Andresito, Misiones, Argentina. Los sitios fueron 1, 2, y 3 (Sitio 1: 25°39'57"S, 54°04'24"O, Sitio 2: 25°32'16"S, 54°08'40"O, Sitio 3 25°32'17"S, 54°08'38"O). Los ciclos de muestreo fueron identificados como 19: 2019-2020; 21: 2021-2022; 23: 2022-2023. Incluyendo esta identificación molecular y datos morfológicos se construyó una base de datos. A partir de los datos estandarizados se construyó una matriz de contingencia, y se aplicaron metodologías multivariadas para evaluar la diversidad. En el desarrollo del plan de tesis, se compararon estas metodologías para observar la que se adecuó según bibliografía y experiencia, a las particularidades de los datos registrados en los sitios y ciclos de muestreo. A continuación se colocan las metodologías comparadas y su identificación en cada pestaña del archivo Excel adjuntado denominado Anexo 2. Metodología+Nivel de diversidad/Identificador de pestaña Análsis de Componentes Principales /ACPAlfa Análisis de Coordenadas Principales/ACorPAlfa Euclídea/EucliBeta Euclídea al cuadrado Beta/Euclial2Beta Jaccard BetaJaccardBeta Bray-Curtis Beta/BracyC Beta Jerárquico Bray-Curtis Gamma/BracyC Gamma Jerárquico Jaccard Gamma/Jaccard Gamma Jerárquico Dice Gamma/Dice Gamma No jerarquicos k-means. Dice y Bray-Curtis/Kmeans NoJ