Puesta a punto de primers para amplificación por PCR de regiones de interés de los genes Clausa, Goblet y Trifoliate de tomate, en ADN previamente tratado con bisulfito de sodio

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Fecha
Publicador:
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
Fecha de depósito:
18/07/2022
Fecha de creación:
09/2019-12/2019
Clasificación temática
Palabras clave
Resumen
El archivo contiene las secuencias de los primers diseñados para amplificar regiones de interés de los genes Clausa, Goblet y Trifoliate de tomate, una vez tratado con bisulfito de sodio el ADN extraído de hojas. Asimismo, se presenta una foto de una electroforesis en gel de agarosa 1% en donde se pueden ver las temperaturas de annealing óptimas, en donde hay mayor amplificación del producto deseado y, al mismo tiempo, no se detecta amplificación cuando el templado no fue tratado con bisulfito previamente. Esto es crucial para minimizar la amplificación de templados no convertidos por bisulfito, lo que llevaría a sobreestimar la metilación del ADN en la región en estudio. Este es un paso clave en el estudio de la metilación sobre citosinas del ADN mediante la técnica del bisulfito de sodio.
Métodos
El archivo muestra la puesta a punto de tres sets de primers para amplificación de regiones de interés de los genes Clausa, Goblet y Trifoliate de tomate, usando como templado ADN extraído de hojas y previamente tratado con bisulfito.
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