Análisis genómico comparativo de variedades de Capsicum annuum: Distribución y abundancia de secuencias repetitivas

Abstract

Pimiento (C. annuum), es una hortaliza considerada de alto valor economico. Esta especie se caracteriza por tener un numero cromosomico de 2n=24 y un genoma relativamente grande (~3.20Gb) dentro de las Solanaceas. Este incremento del tamano genomico esta asociada a la acumulacion de secuencias de ADN repetitivo. Esta fraccion repetitiva fue analizada mediante analisis de clustering con RepeatExplorer2/ Elixir-Cerit. A partir de secuencias genomicas con cobertura de 0,1× para los cultivares Calafyuco, Fyuco y Zunla. El tamano del genoma calculado por citometria de flujo fue 6,80; 7,20 y 7,32 pg, la fraccion repetitiva estimada fue 48,51; 46,23 y 50,59%, para los cultivares Calafyuco, Fyuco y Zunla, respectivamente. Para los tres cultivares. Los principales grupos de elementos repetitivos son LTR de Clase I: Ty3/gypsy-Tekay (22,74; 19,29 y 13,98%); Ty3/gypsy-Athila (4,06; 3,33 y 1,67%); Ty3/gypsy-Ogre (2,29; 2,12 y 2,15%). El ADN repetitivo presento diferencias observadas en: Ty3/gypsy-Reina (presente solamente en Zunla), abundancia de ADN satelite (0,59; 0,22 y 1,02%) y en el ADNr, tanto en 45S (0,38; 0,12 y 0,45%), como en 5S (0,08; 0,10 y 0,03%). Los resultados proporcionan informacion original sobre la abundancia y distribucion cromosomica (FISH) de la fraccion repetitiva en los tres cultivares de pimiento. Permitiendo discutir la utilidad de marcadores citogeneticos y moleculares en el reconocimiento de variedades de importancia agronomica.