Ames Mutagenicity Dataset
; Sabando, María Virginia ; Soto, Axel Juan ; Roca Magadán, Carlos ; Requena Triguero, Carlos ; Campillo Martín, Nuria Eugenia ; Páez, Juan A. ; Ponzoni, Ignacio Otros responsables
Fecha
Publicador:
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
Fecha de depósito:
4/08/2022
Fecha de creación:
2020
Clasificación temática
Palabras clave
Resumen
El dataset contiene 5536 compuestos moleculares representados por su código SMILES y 1360 descriptores moleculares calculados con Mordred. Además, contiene las respectivas etiquetas para cada compuesto (1: mutagénico / 0: no mutagénico) para cada una de las cinco cepas (TA98, TA100, TA102, TA1535, TA1537) y una etiqueta general (Overall) que corresponde a la etiqueta de consenso utilizada para evaluar la predicción final del test de Ames. Los compuestos fueron compilados originalmente por el Istituto Superiore di Sanita’ (https://www.iss.it/isstox) y son el resultado de una etapa de preprocesamiento exhaustiva, que consta de diferentes pasos de filtrado, limpieza y canonicalización.
Información Técnica
El archivo .csv contiene la información necesaria para ser utilizado para tareas de modelado predictivo. Las columnas "TA98", "TA100", "TA102", "TA1535", "TA1537" corresponden a las etiquetas calculadas para cada cepa, mientras que la columna "Overall" corresponde a la etiqueta de consenso utilizada para evaluar la predicción final de mutagenicidad. La columna "Partition" muestra tres valores: "Train", "Internal" and "External", que permite identificar la partición de datos a la que cada compuesto fue asignado durante la experimentación. Todas las columnas restantes corresponden a los descriptores moleculares calculados usando Mordred.
Para más información ver el archivo "README.txt".
Condiciones de uso
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