Determinación de carga viral de Sars-cov-2 en aguas residuales durante la segunda y tercera ola de Covid 19 en Tucumán, Argentina, como herramienta de vigilancia epidemiológica

Abstract

La epidemiología basada en aguas residuales proporciona información temporal y espacial sobre el estado de salud de una población. El objetivo de este trabajo fue analizar y reportar la dinámica epidemiológica de SARS-CoV-2 en la provincia de Tucumán, Argentina durante la segunda y tercera ola de COVID-19. Durante el período comprendido entre abril de 2021 y marzo de 2022 estudiamos 16 puntos de los cuales se obtuvieron aguas residuales a lo largo del tiempo. Para la búsqueda de SARS-CoV-2 se realizó la concentración viral con PEG a partir de las muestras, homogeneización del pellet con TRIZOL seguida de purificación de ARN. La detección de marcadores de nucleocápside del virus (gen N1) se llevó a cabo mediante RT-qPCR en un solo paso. Se determinó la carga viral para cada muestra positiva mediante la realización de una curva estándar. Los resultados se relacionaron con el número de casos positivos en las fechas de muestreo. Un mayor número de copias/ml se observó días previos a los picos de casos, así como también una caída abrupta de casos positivos se asoció a baja carga viral. Nuestros resultados nos permitieron monitorear el comportamiento de la infección por SARS-CoV-2 mediante la determinación de la carga viral durante los brotes epidémicos consistentes con la segunda y tercera ola de Covid-19. El monitoreo de aguas residuales es un indicador epidemiológico útil que permite anticipar el aumento de casos de COVID-19, detectar brotes de infección y así monitorear el avance de la pandemia.