Enzimas de interés biotecnológico en el genoma de Bacillus SP. Mb1

Abstract

El estudio del potencial enzimático de microorganismos es clave para identificar enzimas con características perfeccionadas para el desarrollo de bioprocesos más sostenibles y eficientes. En este trabajo, se realizó la secuenciación del genoma de Bacillus sp. Mb1 mediante la plataforma Illumina (Miseq). El ensamblado de novo de los reads de alta calidad se realizó utilizando el software SPAdes 3.13.0 y la anotación del draft genómico se llevó a cabo utilizando el servidor RAST 2.0. El estudio de la relación filogenética de la cepa se realizó mediante el análisis del Average Nucleotide Identity (ANI). Para la identificación de dominios de enzimas activas sobre carbohidratos (CAZymes), las proteínas traducidas se analizaron con el servidor dbCAN2 meta server. El draft genómico obtenido estuvo constituido de 14 contigs, con un tamaño de 4,3 Mb y un contenido de GC del 45,8%. Además, el análisis de ANI y el árbol filogenético construido relacionaron a la cepa Mb1 con B. licheniformis. A partir de la anotación del genoma fue posible identificar 4541 genes, de los cuales 88 codifican para ARNs y 4453 para proteínas. De estas últimas, el 49 % fueron agrupadas en diferentes subsistemas. En cuanto a las CAZymes, se detectaron 109 genes codificantes para enzimas con algún dominio CAZyme, entre ellas 55 Glicosil-hidrolasas, 28 Glicosil-transferasas, 10 Carbohidrato esterasas y 8 Polisacárido liasas. Se destacan las enzimas involucradas en la degradación de polisacárido de la biomasa vegetal, como almidón, celulosa, xilano, manano y quitina. Además, la capacidad de Mb1 para utilizar estos carbohidratos también fue comprobada de manera semicuantitativa mediante la aparición de halos de degradación en medios sólidos conteniendo dichos sustratos.