Análisis informático de vías de defensa involucradas en la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp. a partir de datos provenientes de rna-seq

Abstract

HuangLongBing (HLB) es la enfermedad más devastadora de los cítricos, que hasta elmomento no cuenta con un tratamiento efectivo. Es causada por bacterias del géneroCandidatus Liberibacter. Son parásitos obligadas de floema y se transmiten por un insectovector (el psílido Diaphorina citri). En Argentina se ha detectado la especie Ca. Liberibacterasiaticus. Estas bacterias aún no se han logrado cultivar, dificultando esto el avance en losestudios de patogenicidad y defensa. Los síntomas del HLB incluyen alteraciones sistémicas enla fisiología y el desarrollo y, en etapas avanzadas, la muerte de la planta. En el presenteestudio se analizaron de forma integrada un conjunto de bases de datos biológicos a partir desecuenciación masiva de ARN proveniente de los ensayos PRJNA203307, PRJNA280255,PRJNA31921, PRJNA348468, PRJNA417324, PRJNA645216. Los perfiles de expresióndiferencial génica en distintas variedades cítricas y tiempos de infección, mostraron que elavance de la enfermedad resulta en alteraciones fisiológicas como: (1) desbalance decarbohidratos relacionado con la interrupción de la relación fuente-sumidero, (2)perturbaciones en el crosstalk de fitohormonas involucradas en inmunidad y desarrollo (SA, JA,brasinosteroides, etc), (3) cambios en la activación rápida de vías de desintoxicación(particularmente GSTs). Este tipo de estudios permite integrar datos e identificar víasmetabólicas y nuevos transcriptos implicados en la activación de defensa que pueden ser útilespara la ingeniería genética.