The genome of the stress-tolerant wild tomato species Solanum pennellii

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dc.conicet.produccionid5680677
dc.contributor.authorBolger, Anthony
dc.contributor.authorScossa, Federico
dc.contributor.authorBolger, Marie E.
dc.contributor.authorLanz, Christa
dc.contributor.authorMaumus, Florian
dc.contributor.authorTohge, Takayuki
dc.contributor.authorQuesneville, Hadi
dc.contributor.authorAlseekh, Saleh
dc.contributor.authorSørensen, Iben
dc.contributor.authorLichtenstein, Gabriela
dc.contributor.authorFich, Eric A.
dc.contributor.authorConte, Mariana
dc.contributor.authorKeller, Heike
dc.contributor.authorSchneeberger, Korbinian
dc.contributor.authorSchwacke, Rainer
dc.contributor.authorOfner, Itai
dc.contributor.authorVrebalov, Julia
dc.contributor.authorXu, Yimin
dc.contributor.authorOsorio, Sonia
dc.contributor.authorAflitos, Saulo Alves
dc.contributor.authorSchijlen, Elio
dc.contributor.authorJiménez Goméz, José M.
dc.contributor.authorRyngajllo, Malgorzata
dc.contributor.authorKimura, Seisuke
dc.contributor.authorKumar, Ravi
dc.contributor.authorKoenig, Daniel
dc.contributor.authorHeadland, Lauren R.
dc.contributor.authorMaloof, Julin N.
dc.contributor.authorSinha, Neelima
dc.contributor.authorVan Ham, Roeland C. H. J.
dc.date.accessioned2022-05-12T18:43:31Z
dc.date.available2022-05-12T18:43:31Z
dc.date.issued2014-09
dc.date.updated2018-02-06T20:08:45Z
dc.description.abstractSolanum pennellii is a wild tomato species endemic to Andean regions in South America, where it has evolved to thrive in arid habitats. Because of its extreme stress tolerance and unusual morphology, it is an important donor of germplasm for the cultivated tomato Solanum lycopersicum1. Introgression lines (ILs) in which large genomic regions of S. lycopersicum are replaced with the corresponding segments from S. pennellii can show remarkably superior agronomic performance2. Here we describe a high-quality genome assembly of the parents of the IL population. By anchoring the S. pennellii genome to the genetic map, we define candidate genes for stress tolerance and provide evidence that transposable elements had a role in the evolution of these traits. Our work paves a path toward further tomato improvement and for deciphering the mechanisms underlying the myriad other agronomic traits that can be improved with S. pennellii germplasm.es
dc.description.filFil: Bolger, Anthony. Aachen University; Alemania. Institut Max Planck fur Molekulare Physiologie; Alemania
dc.description.filFil: Scossa, Federico. Institut Max Planck fur Molekulare Physiologie; Alemania. Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l'Analisi del l'Economía Agraria; Italia
dc.description.filFil: Bolger, Marie E.. Institut Max Planck fur Molekulare Physiologie; Alemania. Forschungszentrum Jülich; Alemania
dc.description.filFil: Lanz, Christa. Institut Max Planck fur Molekulare Physiologie; Alemania
dc.description.filFil: Maumus, Florian. Institut National de la Recherche Agronomique; Francia
dc.description.filFil: Tohge, Takayuki. Institut Max Planck fur Molekulare Physiologie; Alemania
dc.description.filFil: Quesneville, Hadi. Institut National de la Recherche Agronomique; Francia
dc.description.filFil: Alseekh, Saleh. Institut Max Planck fur Molekulare Physiologie; Alemania
dc.description.filFil: Sørensen, Iben. Cornell University; Estados Unidos
dc.description.filFil: Lichtenstein, Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
dc.description.filFil: Fich, Eric A.. Cornell University; Estados Unidos
dc.description.filFil: Conte, Mariana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas; Argentina
dc.description.filFil: Keller, Heike. Institut Max Planck fur Molekulare Physiologie; Alemania
dc.description.filFil: Schneeberger, Korbinian. Institut Max Planck fur Molekulare Physiologie; Alemania. Max Planck Institute for Plant Breeding Research; Alemania
dc.description.filFil: Schwacke, Rainer. Institut Max Planck fur Molekulare Physiologie; Alemania. Forschungszentrum Jülich; Alemania
dc.description.filFil: Ofner, Itai. The Hebrew University of Jerusalem; Israel
dc.description.filFil: Vrebalov, Julia. Cornell University; Estados Unidos
dc.description.filFil: Xu, Yimin. Cornell University; Estados Unidos
dc.description.filFil: Osorio, Sonia. Institut Max Planck fur Molekulare Physiologie; Alemania. Universidad de Málaga; España
dc.description.filFil: Aflitos, Saulo Alves. University of Agriculture Wageningen; Países Bajos
dc.description.filFil: Schijlen, Elio. University of Agriculture Wageningen; Países Bajos
dc.description.filFil: Jiménez Goméz, José M.. Max Planck Institute for Plant Breeding Research; Alemania. Institut National de la Recherche Agronomique; Francia
dc.description.filFil: Ryngajllo, Malgorzata. Institut Max Planck fur Molekulare Physiologie; Alemania
dc.description.filFil: Kimura, Seisuke. University of California at Davis; Estados Unidos
dc.description.filFil: Kumar, Ravi. University of California at Davis; Estados Unidos
dc.description.filFil: Koenig, Daniel. Institut Max Planck fur Molekulare Physiologie; Alemania. University of California at Davis; Estados Unidos
dc.description.filFil: Headland, Lauren R.. University of California at Davis; Estados Unidos
dc.description.filFil: Maloof, Julin N.. University of California at Davis; Estados Unidos
dc.description.filFil: Sinha, Neelima. University of California at Davis; Estados Unidos
dc.description.filFil: Van Ham, Roeland C. H. J.. University of Agriculture Wageningen; Países Bajos
dc.formatapplication/pdfes
dc.identifier.citationBolger, Anthony; Scossa, Federico; Bolger, Marie E.; Lanz, Christa; Maumus, Florian; et al.; The genome of the stress-tolerant wild tomato species Solanum pennellii; Nature Publishing Group; Nature Genetics; 46; 9-2014; 1034-1038es
dc.identifier.eissn1546-1718es
dc.identifier.institucionalCONICET
dc.identifier.issn1061-4036es
dc.identifier.repoCONICET Digital
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11336/157434
dc.journal.pagination1034-1038es
dc.journal.paisEstados Unidoses
dc.journal.titleNature Geneticses
dc.journal.volume46es
dc.language.isoenges
dc.publisherNature Publishing Groupes
dc.relation.alternativeidinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.nature.com/articles/ng.3046
dc.relation.alternativeidinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.1038/ng.3046
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess*
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/*
dc.subjectSolanum Pennelliies
dc.subjectSolanum Lycopersicumes
dc.subjectGenomaes
dc.subjectIlluminaes
dc.subject.classificationOtras Ciencias Biológicases
dc.subject.classificationCiencias Biológicases
dc.subject.classificationCIENCIAS NATURALES Y EXACTASes
dc.titleThe genome of the stress-tolerant wild tomato species Solanum pennelliies
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/artículo
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion

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