Diversidad microbiológica en suelos de cultivares de alfalfa y vid

Abstract

El valle de Calingasta (San Juan),está enclavado en la región fitogeográfica del Monte, donde la agricultura persiste como actividad clave a pesar de las condiciones ambientales extremas. Se caracteriza por un clima árido, con marcada amplitud térmica y una fuerte dependencia del riego proveniente del deshielo. En la zona predominan los cultivos a pequeña escala, incluyendo salicáceas, frutales, forrajeras y hortalizas. Entre los cultivos más representativos se destacan la vid (Vitis vinifera) y la alfalfa (Medicago sativa), el primero como uno delos cultivos que ha experimentado un mayor crecimiento en los últimos veinte años y que representa una oportunidad para el desarrollo local. Mientras que la alfalfa constituye un componente de gran distribución productiva e identitaria. Los microorganismos edáficos constituyen un componente clave para el funcionamiento de los agroecosistemas. En este contexto, el objetivo del presente estudio fue determinar si existen diferencias en la diversidad de bacterias y hongos del suelo entre viñedos y alfalfares del valle. Para ello,se recolectaron muestras de suelo a 20 cm de profundidad en parcelas de 30 × 30m correspondientes a ambos tipos de cultivo. De cada parcela se tomaron cinco muestras de suelo y se mezclaron obteniendo muestras compuestas. La diversidad de bacterias y hongos fue descrita a partir de la secuenciación del ADN total extraído de las muestras, por amplificación con cebadores para las regionesV3-V4 del gen 16S ARNr y para las regiones ITS. Los datos de secuenciación generados se analizaron en la plataforma online Nephele. Se observaron diferencias entre las comunidades microbianas de ambos cultivares. La diversidad fúngica fue baja. Lo más notable fue la elevada presencia de los géneros bacterianos Escherichia/Shigella (25 a 50%). Esto podría deberse a heces de animales domésticos o silvestres en los cultivos, o también provenir del agua de riego o de abono. Estos microorganismos pueden persistir en suelos con alto contenido de materia orgánica y humedad, comunes en sistemas de riego intensivo, y representan un potencial riesgo para la salud.