Genomic and phylogenetic analysis of hepatitis C virus isolates from Argentine patients: A six-year retrospective study

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dc.conicet.fuenteindividual
dc.conicet.organizacionUniversidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología
dc.conicet.organizacionConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay
dc.conicet.organizacionCenters For Disease Control And Prevention. National Center For Infectious Diseases
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dc.conicet.paisOrganizacionArgentina
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dc.conicet.paisOrganizacionEstados Unidos
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dc.conicet.produccionid6532615
dc.contributor.authorQuarleri, Jorge Fabian
dc.contributor.authorRobertson, B.H.
dc.contributor.authorMathet, Veronica Lidia
dc.contributor.authorFeld, Mariana
dc.contributor.authorEspínola, Luis Alberto
dc.contributor.authorRequeijo, M.P.
dc.contributor.authorMandó, Oscar Gaspar
dc.contributor.authorCarballal, Guadalupe
dc.contributor.authorOubiña, Jose Raul
dc.date.accessioned2021-04-19T12:06:16Z
dc.date.available2021-04-19T12:06:16Z
dc.date.issued2000-12
dc.date.updated2020-09-11T19:46:41Z
dc.description.abstractTyping of hepatitis C virus (HCV) isolates from Argentine patients was performed by using different methodologies in a population of 243 patients. HCV subtype was assigned based upon restriction fragment length polymorphism (RFLP). HCV RNA genomes obtained from serum samples were classified as belonging to clade 1 (53.5%), 2 (23.0%), or 3 (8.6%); 14.8% of samples showed HCV mixed infections, more frequently implying different subtypes within the same clade. In addition to RFLP typing, phylogenetic relatedness among sequences from both 5′ untranslated region (n = 50) and nonstructural 5B coding region (n = 15) was established.es
dc.description.filFil: Quarleri, Jorge Fabian. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina
dc.description.filFil: Robertson, B.H.. Centers For Disease Control And Prevention. National Center For Infectious Diseases; Estados Unidos
dc.description.filFil: Mathet, Veronica Lidia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
dc.description.filFil: Feld, Mariana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina
dc.description.filFil: Espínola, Luis Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina
dc.description.filFil: Requeijo, M.P.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. CEMIC-CONICET. Centro de Educaciones Médicas e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno". CEMIC-CONICET; Argentina
dc.description.filFil: Mandó, Oscar Gaspar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. CEMIC-CONICET. Centro de Educaciones Médicas e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno". CEMIC-CONICET; Argentina
dc.description.filFil: Carballal, Guadalupe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. CEMIC-CONICET. Centro de Educaciones Médicas e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno". CEMIC-CONICET; Argentina
dc.description.filFil: Oubiña, Jose Raul. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
dc.formatapplication/pdfes
dc.identifier.citationQuarleri, Jorge Fabian; Robertson, B.H.; Mathet, Veronica Lidia; Feld, Mariana; Espínola, Luis Alberto; et al.; Genomic and phylogenetic analysis of hepatitis C virus isolates from Argentine patients: A six-year retrospective study; American Society for Microbiology; Journal of Clinical Microbiology; 38; 12; 12-2000; 4560-4568es
dc.identifier.institucionalCONICET
dc.identifier.issn0095-1137es
dc.identifier.repoCONICET Digital
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11336/130328
dc.journal.ciudadWashingtones
dc.journal.number12es
dc.journal.pagination4560-4568es
dc.journal.paisEstados Unidoses
dc.journal.titleJournal of Clinical Microbiologyes
dc.journal.volume38es
dc.language.isoenges
dc.publisherAmerican Society for Microbiologyes
dc.relation.alternativeidinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://jcm.asm.org/content/38/12/4560.long
dc.relation.alternativeidinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC87637/
dc.relation.alternativeidinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1128/JCM.38.12.4560-4568.2000
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess*
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/*
dc.subjectHepatitis C viruses
dc.subjectHCV genotypeses
dc.subjectArgentinaes
dc.subjectPhylogenetic analysises
dc.subject.classificationBioquímica y Biología Moleculares
dc.subject.classificationMedicina Básicaes
dc.subject.classificationCIENCIAS MÉDICAS Y DE LA SALUDes
dc.titleGenomic and phylogenetic analysis of hepatitis C virus isolates from Argentine patients: A six-year retrospective studyes
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/artículo
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion

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