La biorremediación en la era post-genómica

Abstract

La biorremediación tiene hoy en día gran aceptación como una estrategia efectiva para la recuperación de suelos contaminados, sin embargo la falta de información sobre los factores que rigen el funcionamiento metabólico de las comunidades microbianas en los ambientes contaminados hace que, aún en la actualidad, los procesos de biorremediación tengan resultados impredecibles. Las técnicas moleculares basadas en el estudio del DNA, han permitido la identificación de numerosos genes catabólicos abriendo nuevas oportunidades en el desarrollo de los procesos de biorremediación. En esta nueva era post-genómica, las emergentes metatranscriptómica, metaproteómica y metabolómica resultan promesas notables como herramientas para estudiar los mecanismos implicados en la regulación de las vías de degradación, lo que en un futuro nos permitirá desarrollar modelos predictivos sobre la actividad degradadora de la comunidad microbiana del suelo en función de los distintos parámetros bióticos y abióticos, y establecer criterios específicos y claros sobre la elección y evaluación de las estrategias de biorremediación.

Bioremediation is nowadays widely accepted as an effective strategy for the recovery of contaminated soils; however the lack of information about the factors that govern the metabolic functioning of microbial communities in contaminated environments means that, still at present, the bioremediation processes have unpredictable results. The molecular techniques based on DNA studies have allowed the identification of numerous catabolic genes opening new opportunities in the development of bioremediation processes. In this new post-genomic era, emerging metatranscriptomics, metaproteomics and metabolomics are remarkable promises as tools to study the mechanisms involved in the regulation of degradation pathways, which in the future will allow us to develop predictive models of degrading activity of the soil microbial community according to the various biotic and abiotic parameters, establishing specific and clear criteria for the selection and evaluation of bioremediation strategies.