Proteómica de frutos de tomate en dos líneas parentales y su cruzamiento interespecífico F1

Abstract

Los experimentos se realizaron en el campo experimental “J. F. Villarino” (Zavalla, Argentina). Se utilizaron como materiales de estudio dos genotipos parentales de tomate: el cultivar domesticado Caimanta de Solanum lycopersicum L. (C) y la accesión LA0722 de la especie silvestre Solanum pimpinellifolium (P), junto con su híbrido F1 interespecífico (CxP). Los frutos fueron cosechados en tres estados de madurez: verde maduro (V), pintón (Pi) y rojo maduro (R) y el pericarpio fue separado inmediatamente, congelado en nitrógeno líquido y almacenado a −80 °C hasta su posterior extración de proteínas. Se extrajeron proteínas totales de pooles de tres frutos de C, P y F1, a partir de 3 réplicas técnicas del tejido pericarpio (500 mg) que se homogeneizaron con nitrógeno líquido. La identificación y cuantificación de las proteínas se realizó en el Centro de Estudios Químicos y Biológicos por Espectrometría de Masas (CEQUIBIEM) de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de Buenos Aires (www.cequibiem.qb.fcen.uba.ar). Las proteínas se analizaron por nano HPLC (EASY-nLC 1000, Thermo Scientific, Germany) acoplado a un espectrómetro de masas de tecnología Orbitrap (Q-Exactive High Collision Dissociation cell & Orbitrap Analyser, Thermo Scientific, Germany). Los datos obtenidos se analizaron con el software Proteome Discoverer 2.2 (Thermo Scientific, Germany). La cuantificación se realizó con el software MassChroQ (Valot et al., 2011). Se utilizó el proteoma de referencia de Solanum lycopersicum cv. Heinz 1706 (UP000004994). Los tests estadísticos se realizaron en la plataforma Perseus.