WGS of high risk clone ST147 Klebsiella pneumoniae coharboring mcr-1 and blaNDM-1
; Gutkind, Gabriel Osvaldo ; Gonzales Escalante, Edgar ; Ruggiero, Melina Otros responsables
Fecha
Publicador:
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
Fecha de depósito:
13/01/2025
Fecha de creación:
17/02/2021
Clasificación temática
Palabras clave
Resumen
In this work, we report the first genome sequence of an international critical clone of MCR-1-, NDM-1-, and CTXM-15-producing K. pneumoniae ST147 in Peru, highlighting cocarriage of multiple drug resistance determinants.
Métodos
Whole-genome sequencing of K. pneumoniae COL17 was performed through short reads (NextSeq, Illumina Paired-end PE platform) and long reads (MinION; Oxford Nanopore Technologies). De novo long-read-only assembly was performed with Flye v 2.6 followed by short-read polishing with Pilon v 1.20.1.
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