Resolviendo la sistemática de los tuco-tucos (Ctenomys, Rodentia) mediante un abordaje filogenómico y un muestreo taxonómico denso

Abstract

Los tuco-tucos son roedores subterráneos del género Ctenomys endémicos de Sudamérica que han experimentado una radiación relativamente reciente. Resaltan por su riqueza de especies, extraordinaria diversidad cromosómica y amplia distribución. Las relaciones filogenéticas entre las 64 especies reconocidas en la última revisión han sido difíciles de resolver. En particular, las relaciones entre grupos de especies presentaron bajo apoyo estadístico, empleando tanto genes mitocondriales como nucleares. Este estudio intenta contribuir a la resolución de la filogenia del género usando secuenciación masiva, generando miles de marcadores moleculares independientes, obtenidos mediante RAD seq (digiriendo con enzima Sbf1), e incluyendo el 75% de las especies reconocidas. Las secuencias obtenidas fueron mapeadas contra el genoma de C. sociabilis, recuperándose como máximo140000 sitios polimórficos (SNP). Para la reconstrucción filogenética se usaron aquellas muestras con más del 20%de SNP. La filogenia obtenida por Máxima Verosimilitud corrobora con gran apoyo estadístico (>99%) los principales grupos filogenéticos previamente propuestos con citocromo b, aunque los vínculos entre ellos son distintos a los anteriormente reportados. El nuevo grupo sociabilis (C. sociabilis y C. plebiscitum) es hermano de todos los demás tuco-tucos. Los grupos magellanicus y mendocinus son hermanos, y están incluidos en el clado formado poros grupos boliviensis, talarum, tucumanus, torquatus,y opimus. Se propone incluir a C. famosus, C. coludo, C.bergi, C. johannis y C. fochi en el grupo mendocinus, a C.erikacullerae, C. andersoni y C. yatesi en el grupo boliviensis, a C. lessai en el grupo frater, y a C. viperinus y C. jurisen el grupo tucumanus. Ctenomys leucodon se recupera como la especie hermana del grupo frater con moderado apoyo estadístico. Estos resultados contribuyen a resolverlas relaciones filogenéticas en este grupo tan diverso y permitirán entender los patrones macroevolutivos del género Ctenomys, así como los patrones de diversificación y biogeografía histórica del grupo.