A GWAS in Latin Americans highlights the convergent evolution of lighter skin pigmentation in Eurasia

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dc.conicet.paisOrganizacionChina
dc.conicet.produccionid8145772
dc.contributor.authorAdhikari, Kaustubh
dc.contributor.authorMendoza Revilla, Javier
dc.contributor.authorSohail, Anood
dc.contributor.authorFuentes Guajardo, Macarena
dc.contributor.authorLampert, Jodie
dc.contributor.authorChacón Duque, Juan Camilo
dc.contributor.authorHurtado, Malena
dc.contributor.authorVillegas, Valeria
dc.contributor.authorGranja, Vanessa
dc.contributor.authorAcuña Alonzo, Victor
dc.contributor.authorJaramillo, Claudia
dc.contributor.authorArias, William
dc.contributor.authorLozano, Rodrigo Barquera
dc.contributor.authorEverardo, Paola
dc.contributor.authorGómez Valdés, Jorge
dc.contributor.authorVillamil-Ramírez, Hugo
dc.contributor.authorSilva de Cerqueira, Caio C.
dc.contributor.authorHünemeier, Tábita
dc.contributor.authorRamallo, Virginia
dc.contributor.authorSchuler Faccini, Lavinia
dc.contributor.authorSalzano, Francisco M.
dc.contributor.authorGonzález José, Rolando
dc.contributor.authorBortolini, Maria Catira
dc.contributor.authorCanizales Quinteros, Samuel
dc.contributor.authorGallo, Carla
dc.contributor.authorPoletti, Giovanni
dc.contributor.authorBedoya, Gabriel
dc.contributor.authorRothhammer, Francisco
dc.contributor.authorTobin, Desmond J.
dc.contributor.authorFumagalli, Matteo
dc.contributor.authorBalding, David
dc.contributor.authorRuiz-Linares, Andres
dc.date.accessioned2020-03-17T15:18:16Z
dc.date.available2020-03-17T15:18:16Z
dc.date.issued2019-12
dc.date.updated2019-12-11T18:52:14Z
dc.description.abstractWe report a genome-wide association scan in >6,000 Latin Americans for pigmentation of skin and eyes. We found eighteen signals of association at twelve genomic regions. These include one novel locus for skin pigmentation (in 10q26) and three novel loci for eye pigmentation (in 1q32, 20q13 and 22q12). We demonstrate the presence of multiple independent signals of association in the 11q14 and 15q13 regions (comprising the GRM5/TYR and HERC2/OCA2 genes, respectively) and several epistatic interactions among independently associated alleles. Strongest association with skin pigmentation at 19p13 was observed for an Y182H missense variant (common only in East Asians and Native Americans) in MFSD12, a gene recently associated with skin pigmentation in Africans. We show that the frequency of the derived allele at Y182H is significantly correlated with lower solar radiation intensity in East Asia and infer that MFSD12 was under selection in East Asians, probably after their split from Europeans.es
dc.description.filFil: Adhikari, Kaustubh. Colegio Universitario de Londres; Reino Unido
dc.description.filFil: Mendoza Revilla, Javier. Universidad Peruana Cayetano Heredia; Perú. Colegio Universitario de Londres; Reino Unido
dc.description.filFil: Sohail, Anood. University of Cambridge; Reino Unido
dc.description.filFil: Fuentes Guajardo, Macarena. Colegio Universitario de Londres; Reino Unido. Universidad de Tarapacá de Arica; Chile
dc.description.filFil: Lampert, Jodie. University of Leicester; Reino Unido
dc.description.filFil: Chacón Duque, Juan Camilo. Colegio Universitario de Londres; Reino Unido
dc.description.filFil: Hurtado, Malena. Universidad Peruana Cayetano Heredia; Perú
dc.description.filFil: Villegas, Valeria. Universidad Peruana Cayetano Heredia; Perú
dc.description.filFil: Granja, Vanessa. Universidad Peruana Cayetano Heredia; Perú
dc.description.filFil: Acuña Alonzo, Victor. Instituto Nacional de Antropología E Historia; México. Colegio Universitario de Londres; Reino Unido
dc.description.filFil: Jaramillo, Claudia. Universidad de Antioquia; Colombia
dc.description.filFil: Arias, William. Universidad de Antioquia; Colombia
dc.description.filFil: Lozano, Rodrigo Barquera. Instituto Nacional de Antropología E Historia; México. Max Planck Institute For The Science Of Human History; Alemania
dc.description.filFil: Everardo, Paola. Instituto Nacional de Antropología E Historia; México
dc.description.filFil: Gómez Valdés, Jorge. Instituto Nacional de Antropología E Historia; México
dc.description.filFil: Villamil-Ramírez, Hugo. Instituto Nacional de Medicina Genómica; México
dc.description.filFil: Silva de Cerqueira, Caio C.. Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Brasil
dc.description.filFil: Hünemeier, Tábita. Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Brasil
dc.description.filFil: Ramallo, Virginia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto Patagónico de Ciencias Sociales y Humanas; Argentina
dc.description.filFil: Schuler Faccini, Lavinia. Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Brasil
dc.description.filFil: Salzano, Francisco M.. Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Brasil
dc.description.filFil: González José, Rolando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto Patagónico de Ciencias Sociales y Humanas; Argentina
dc.description.filFil: Bortolini, Maria Catira. Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Brasil
dc.description.filFil: Canizales Quinteros, Samuel. Instituto Nacional de Medicina Genómica; México
dc.description.filFil: Gallo, Carla. Universidad Peruana Cayetano Heredia; Perú
dc.description.filFil: Poletti, Giovanni. Universidad Peruana Cayetano Heredia; Perú
dc.description.filFil: Bedoya, Gabriel. Universidad de Antioquia; Colombia
dc.description.filFil: Rothhammer, Francisco. Universidad de Tarapacá de Arica; Chile. Universidad de Chile; Chile
dc.description.filFil: Tobin, Desmond J.. University College Dublin; Irlanda. University Of Bradford; Reino Unido
dc.description.filFil: Fumagalli, Matteo. Imperial College London; Reino Unido
dc.description.filFil: Balding, David. University of Melbourne; Australia. Colegio Universitario de Londres; Reino Unido
dc.description.filFil: Ruiz-Linares, Andres. Fudan University; China
dc.formatapplication/pdfes
dc.identifier.citationAdhikari, Kaustubh; Mendoza Revilla, Javier; Sohail, Anood; Fuentes Guajardo, Macarena; Lampert, Jodie; et al.; A GWAS in Latin Americans highlights the convergent evolution of lighter skin pigmentation in Eurasia; Nature Publishing Group; Nature Communications; 10; 1; 12-2019; 1-16es
dc.identifier.institucionalCONICET
dc.identifier.issn2041-1723es
dc.identifier.repoCONICET Digital
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11336/99811
dc.journal.number1es
dc.journal.pagination1-16es
dc.journal.paisReino Unidoes
dc.journal.titleNature Communicationses
dc.journal.volume10es
dc.language.isoenges
dc.publisherNature Publishing Groupes
dc.relation.alternativeidinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.1038/s41467-018-08147-0
dc.relation.alternativeidinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.nature.com/articles/s41467-018-08147-0
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess*
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/*
dc.subjectLATIN AMERICANSes
dc.subjectGWASes
dc.subjectSKIN PIGMENTATIONes
dc.subjectADMIXTUREes
dc.subject.classificationGenética y Herenciaes
dc.subject.classificationCiencias Biológicases
dc.subject.classificationCIENCIAS NATURALES Y EXACTASes
dc.titleA GWAS in Latin Americans highlights the convergent evolution of lighter skin pigmentation in Eurasiaes
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/artículo
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion

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