Perfil transcriptómico de la respuesta a frío de Triticum turgidum ssp durum en etapa reproductiva

Abstract

El trigo candeal se cultiva principalmente en el sur de la provincia de Buenos Aires, donde se producen heladas hasta finales de octubre. El objetivo fue identificar genes y vías metabólicas relacionadas con la respuesta a frío en etapa reproductiva. Se partió de hojas bandera de plantas espigadas de la línea CBW0101 (primaveral, buen comportamiento frente a heladas). Las plantas fueron expuestas a rampa de 15 a 5°C donde permanecieron 5 hs y se procedió a la extracción de ARN (tres réplicas biológicas). Plantas control permanecieron a 22◦C/16◦C. El secuenciado se realizó con plataforma Illumina (INDEAR). Se obtuvieron 301 Mi de lecturas de calidad y el ensamblado de novo con Trinity generó 113.715 unigenes de los cuales el 42% presentó anotación funcional con SwissProt, PFAM y Gene Onthology (GO). El mapeo de vías metabólicas se realizó con la base Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG). Se detectaron 966 genes con expresión diferencial (p≤0,001), de los cuales 619 presentaron mayor expresión en las plantas sometidas a frío. La categoría Procesos Biológicos (GO) incluyó 17 ítems diferencialmente representados (inducción por frío). KEGG mostró que las vías del metabolismo de almidón y sacarosa, las de cisteína y metionina, las de biosíntesis de aminoácidos y ritmo circadiano fueron las más representadas en las plantas tratadas.Entre los genes con expresión diferencial se identificaron factores de transcripción asociados a estrés: WRKY, AP2, DREB, MYB, bZIP y bHLH. Los genes inducidos representan candidatos para tolerancia a frío de un trigo candeal primaveral en estado reproductivo.