Distribution of molecular subtypes of advanced lung adenocarcinoma and clinical outcomes in a center of Argentina

Abstract

La prevalencia de alteraciones en oncogenes en adenocarcinoma de pulmón varía en nuestra región. El objetivo fue describir la prevalencia de mutaciones en KRAS, BRAF y EGFR y las translocaciones de ALK en pacientes con adenocarcinoma de pulmón y estudiar la supervivencia de acuerdo a subtipos moleculares. Se incluyeron pacientes con biopsias adecuadas para el estudio. Se evaluó el estado mutacional de KRAS, BRAF y EGFR por secuenciación con la técnica de Sanger. Las translocaciones de ALK se estudiaron por hibridación in situ por fluorescencia (FISH) e inmunohistoquimica (IHQ) contra ALK (clones D5F3 y 5A4). De 118 pacientes evaluados, se incluyeron 84 (72%) con análisis molecular completo. Se detectaron mutaciones de KRAS en 16 muestras (19%), EGFR en 11 (13%), y BRAF en 1 muestra (1%). Se detectaron rearreglos de ALK en 3 muestras (4%). La mediana de seguimiento de los pacientes fue de 42.4 [rango intercuatilo (RIC): 27.0-64.2] meses. Globalmente, la mediana de supervivencia en la población fue 10.3 [RIC: 5.6-20.2] meses y fue de 10.8 [RIC: 6.0 20.3] meses en pacientes sin alteraciones moleculares detectables. La mediana de supervivencia de los pacientes con mutación en KRAS fue de 9.6 [RIC: 3.7-16.1] meses (HR: 1.08; p = 0.82) y 32.5 [RIC: 19.6-38.4] meses en el grupo con rearreglos de ALK o mutaciones en EGFR tratados con inhibidores de tirosina quinasa (HR: 0.27; p = 0.03). En conclusión, la prevalencia de alteraciones moleculares en nuestra población fue similar a otros países occidentales.

The prevalence of relevant oncogenic drivers in lung adenocarcinoma varies in our region and data on clinical outcomes is scarce. The objective of the study was to describe the prevalence of KRAS, BRAF and EGFR mutations and ALK translocations in patients with advanced lung adenocarcinoma, and to depict the clinical outcome according to treatment strategies. Patients with adequate tumor biopsy sampling were included. KRAS, BRAF and EGFR mutations were studied by Sanger sequencing. ALK translocations were studied by fluorescent in situ hybridization (FISH) and immunohistochemistry (IH) with antibodies against ALK with clones D5F3 and 5A4. Informed consent was signed by 118 patients and 84 (72%) with complete molecular analysis were included. KRAS mutations were detected in 16 samples (19%), EGFR in 11 (13%), 9 of them conferring sensitivity to EGFR inhibitors, and BRAF mutations in 1 (1%). ALK translocations were detected in 3 samples (4%). Median follow-up was 42.4 [interquartile range (IQR): 27.0-64.2] months. Globally, median overall survival was 10.3 [IQR: 5.6-20.2] months. Median survival was 10.8 [IQR: 6.0-20.3] months in the group of patients without detectable molecular alteration, 9.6 [IQR: 3.7-16.1] months in KRAS mutant population (HR: 1.08; p = 0.82) and 32.5 [IQR: 19.6-38.4] months in patients with ALK translocations or sensitizing EGFR mutated tumors treated with tyrosine kinase inhibitors (HR: 0.27; p = 0.03). In conclusion, the prevalence of molecular alterations and outcomes in our population is similar to that reported in other studies in Western countries.