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dc.contributor.author
Ramos, Pablo Ivan Pereira
dc.contributor.author
Fernández Do Porto, Darío Augusto
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dc.contributor.author
Lanzarotti, Esteban Omar
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dc.contributor.author
Sosa, Ezequiel
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dc.contributor.author
Burguener, Germán Federico
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dc.contributor.author
Pardo, Agustin Maria
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dc.contributor.author
Klein, Cecilia C.
dc.contributor.author
Sagot, Marie-France
dc.contributor.author
De Vasconcelos, Ana Tereza R.
dc.contributor.author
Gales, Ana Cristina
dc.contributor.author
Marti, Marcelo Adrian
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dc.contributor.author
Turjanski, Adrian
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dc.contributor.author
Nicolás, Marisa F.
dc.date.available
2019-12-19T15:44:49Z
dc.date.issued
2018-07
dc.identifier.citation
Ramos, Pablo Ivan Pereira; Fernández Do Porto, Darío Augusto; Lanzarotti, Esteban Omar; Sosa, Ezequiel; Burguener, Germán Federico; et al.; An integrative, multi-omics approach towards the prioritization of Klebsiella pneumoniae drug targets; Nature Publishing Group; Scientific Reports; 8; 1; 7-2018; 1-19
dc.identifier.issn
2045-2322
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/92545
dc.description.abstract
Klebsiella pneumoniae (Kp) is a globally disseminated opportunistic pathogen that can cause life-threatening infections. It has been found as the culprit of many infection outbreaks in hospital environments, being particularly aggressive towards newborns and adults under intensive care. Many Kp strains produce extended-spectrum β-lactamases, enzymes that promote resistance against antibiotics used to fight these infections. The presence of other resistance determinants leading to multidrug-resistance also limit therapeutic options, and the use of 'last-resort' drugs, such as polymyxins, is not uncommon. The global emergence and spread of resistant strains underline the need for novel antimicrobials against Kp and related bacterial pathogens. To tackle this great challenge, we generated multiple layers of 'omics' data related to Kp and prioritized proteins that could serve as attractive targets for antimicrobial development. Genomics, transcriptomics, structuromic and metabolic information were integrated in order to prioritize candidate targets, and this data compendium is freely available as a web server. Twenty-nine proteins with desirable characteristics from a drug development perspective were shortlisted, which participate in important processes such as lipid synthesis, cofactor production, and core metabolism. Collectively, our results point towards novel targets for the control of Kp and related bacterial pathogens.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Nature Publishing Group
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Klebsiella pneumoniae
dc.subject
bioinformática
dc.subject
genómica
dc.subject
drug discovery
dc.subject.classification
Enfermedades Infecciosas
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dc.subject.classification
Ciencias de la Salud
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dc.subject.classification
CIENCIAS MÉDICAS Y DE LA SALUD
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dc.title
An integrative, multi-omics approach towards the prioritization of Klebsiella pneumoniae drug targets
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2019-12-16T19:14:07Z
dc.journal.volume
8
dc.journal.number
1
dc.journal.pagination
1-19
dc.journal.pais
Reino Unido
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dc.description.fil
Fil: Ramos, Pablo Ivan Pereira. Fundación Oswaldo Cruz; Brasil. Laboratorio Nacional de Computacao Cientifica; Brasil
dc.description.fil
Fil: Fernández Do Porto, Darío Augusto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo; Argentina
dc.description.fil
Fil: Lanzarotti, Esteban Omar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Sosa, Ezequiel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo; Argentina
dc.description.fil
Fil: Burguener, Germán Federico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo; Argentina
dc.description.fil
Fil: Pardo, Agustin Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Klein, Cecilia C.. Université Claude Bernard Lyon 1; Francia. Universidad de Barcelona; España
dc.description.fil
Fil: Sagot, Marie-France. Université Claude Bernard Lyon 1; Francia
dc.description.fil
Fil: De Vasconcelos, Ana Tereza R.. Laboratorio Nacional de Computacao Cientifica; Brasil
dc.description.fil
Fil: Gales, Ana Cristina. Universidade de Sao Paulo; Brasil
dc.description.fil
Fil: Marti, Marcelo Adrian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Turjanski, Adrian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Nicolás, Marisa F.. Laboratorio Nacional de Computacao Cientifica; Brasil
dc.journal.title
Scientific Reports
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.nature.com/articles/s41598-018-28916-7
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1038/s41598-018-28916-7
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