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dc.contributor.author Vlasova, Anna
dc.contributor.author Capella Gutiérrez, Salvador
dc.contributor.author Rendón Anaya, Martha
dc.contributor.author Hernández Oñate, Miguel
dc.contributor.author Minoche, André E.
dc.contributor.author Erb, Ionas
dc.contributor.author Câmara, Francisco
dc.contributor.author Prieto Barja, Pablo
dc.contributor.author Corvelo, André
dc.contributor.author Sanseverino, Walter
dc.contributor.author Westergaard, Gastón
dc.contributor.author Dohm, Juliane C.
dc.contributor.author Pappas Jr., Georgios J.
dc.contributor.author Saburido Alvarez, Soledad
dc.contributor.author Kedra, Darek
dc.contributor.author Gonzalez, Irene
dc.contributor.author Cozzuto, Luca
dc.contributor.author Gómez Garrido, Jessica
dc.contributor.author Aguilar Morón, María A.
dc.contributor.author Andreu, Nuria
dc.contributor.author Aguilar, Orlando Mario
dc.contributor.author Garcia Mas, Jordi
dc.contributor.author Zehnsdorf, Maik
dc.contributor.author Vazquez, Martin Pablo
dc.contributor.author Delgado Salinas, Alfonso
dc.contributor.author Delaye, Luis
dc.contributor.author Lowy, Ernesto
dc.contributor.author Mentaberry, Alejandro Nestor
dc.contributor.author Vianello Brondani, Rosana P.
dc.contributor.author García, José Luís
dc.contributor.author Alioto, Tyler
dc.contributor.author Sánchez, Federico
dc.contributor.author Himmelbauer, Heinz
dc.contributor.author Santalla, Marta
dc.contributor.author Notredame, Cedric
dc.contributor.author Gabaldón, Toni
dc.contributor.author Herrera Estrella, Alfredo
dc.contributor.author Guigó, Roderic
dc.date.available 2018-12-18T19:22:40Z
dc.date.issued 2016-02-25
dc.identifier.citation Vlasova, Anna; Capella Gutiérrez, Salvador; Rendón Anaya, Martha; Hernández Oñate, Miguel; Minoche, André E.; et al.; Genome and trascriptome analysis of the Mesoamerican common bean and the role of gene duplications in establishing tissue and temporal specialization of genes; BioMed Central; Genome Biology; 17; 32; 25-2-2016; 1-18
dc.identifier.issn 1474-760X
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11336/66692
dc.description.abstract We report the genome and the transcription atlas of coding and non-coding genes of a Mesoamerican genotype of common bean (Phaseolus vulgaris L., BAT93). Using a comprehensive phylogenomics analysis, we assessed the past and recent evolution of common bean, and traced the diversification of patterns of gene expression following duplication. We find that successive rounds of gene duplications in legumes have shaped tissue and developmental expression, leading to increased levels of specialization in larger gene families. We also find that many long non-coding RNAs are preferentially expressed in germ-line-related tissues (pods and seeds), suggesting that they play a significant role in fruit development. Our results also suggest that most bean-specific gene family expansions, including resistance gene clusters, predate the split of the Mesoamerican and Andean gene pools.
dc.format application/pdf
dc.language.iso eng
dc.publisher BioMed Central
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject Genome
dc.subject Common bean
dc.subject transcriptome
dc.subject.classification Otras Ciencias Biológicas
dc.subject.classification Ciencias Biológicas
dc.subject.classification CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title Genome and trascriptome analysis of the Mesoamerican common bean and the role of gene duplications in establishing tissue and temporal specialization of genes
dc.type info:eu-repo/semantics/article
dc.type info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated 2018-10-16T18:29:35Z
dc.journal.volume 17
dc.journal.number 32
dc.journal.pagination 1-18
dc.journal.pais Reino Unido
dc.journal.ciudad Londres
dc.description.fil Fil: Vlasova, Anna. Centro de Regulación Genómica; España
dc.description.fil Fil: Capella Gutiérrez, Salvador. Centro de Regulación Genómica; España. Fungal Biodiversity Centre. Yeast and Basidiomycete Research Group; Países Bajos. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil Fil: Rendón Anaya, Martha. Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad; México
dc.description.fil Fil: Hernández Oñate, Miguel. Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad; México
dc.description.fil Fil: Minoche, André E.. Garvan Institute of Medical Research; Australia
dc.description.fil Fil: Erb, Ionas. Centro de Regulación Genómica; España. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil Fil: Câmara, Francisco. Centro de Regulación Genómica; España. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil Fil: Prieto Barja, Pablo. Centro de Regulación Genómica; España. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil Fil: Corvelo, André. New York Genome Center; Estados Unidos
dc.description.fil Fil: Sanseverino, Walter. Centre for Research in Agricultural Genomics; España
dc.description.fil Fil: Westergaard, Gastón. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Rosario. Instituto de Agrobiotecnología de Rosario; Argentina
dc.description.fil Fil: Dohm, Juliane C.. University of Natural Resources and Life Sciences. Department of Biotechnology; Austria
dc.description.fil Fil: Pappas Jr., Georgios J.. Universidade do Brasília; Brasil
dc.description.fil Fil: Saburido Alvarez, Soledad. Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad; México
dc.description.fil Fil: Kedra, Darek. Centro de Regulación Genómica; España. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil Fil: Gonzalez, Irene. Centro de Regulación Genómica; España. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil Fil: Cozzuto, Luca. Universitat Pompeu Fabra; España. Centro de Regulación Genómica; España
dc.description.fil Fil: Gómez Garrido, Jessica. Centro de Regulación Genómica; España. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil Fil: Aguilar Morón, María A.. Centro de Regulación Genómica; España. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil Fil: Andreu, Nuria. Centro de Regulación Genómica; España. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil Fil: Aguilar, Orlando Mario. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular; Argentina
dc.description.fil Fil: Garcia Mas, Jordi. Centre for Research in Agricultural Genomics; España
dc.description.fil Fil: Zehnsdorf, Maik. Universitat Pompeu Fabra; España. Centro de Regulación Genómica; España
dc.description.fil Fil: Vazquez, Martin Pablo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Rosario. Instituto de Agrobiotecnología de Rosario; Argentina
dc.description.fil Fil: Delgado Salinas, Alfonso. Universidad Nacional Autónoma de México. Instituto de Biología. Departamento de Botánica; México
dc.description.fil Fil: Delaye, Luis. Cinvestav. Unidad Irapuato. Departamento de Ingeniería Genética; México
dc.description.fil Fil: Lowy, Ernesto. European Molecular Biology Laboratory; Reino Unido
dc.description.fil Fil: Mentaberry, Alejandro Nestor. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.fil Fil: Vianello Brondani, Rosana P.. Ministerio da Agricultura Pecuaria e Abastecimento de Brasil. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria; Brasil
dc.description.fil Fil: García, José Luís. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Centro de Investigaciones Biológicas. Departamento de Biología Medioambiental; España
dc.description.fil Fil: Alioto, Tyler. Universitat Pompeu Fabra; España. Centro de Regulación Genómica; España
dc.description.fil Fil: Sánchez, Federico. Universidad Nacional Autónoma de México. Instituto Biotecnología. Departamento de Biología Molecular de Plantas; México
dc.description.fil Fil: Himmelbauer, Heinz. University of Natural Resources and Life Sciences. Department of Biotechnology; Austria
dc.description.fil Fil: Santalla, Marta. Misión Biológica de Galicia; España
dc.description.fil Fil: Notredame, Cedric. Centro de Regulación Genómica; España
dc.description.fil Fil: Gabaldón, Toni. Centro de Regulación Genómica; España. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil Fil: Herrera Estrella, Alfredo. Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad; México
dc.description.fil Fil: Guigó, Roderic. Universitat Pompeu Fabra; España. Centro de Regulación Genómica; España
dc.journal.title Genome Biology
dc.relation.alternativeid info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://genomebiology.com/2016/17/1/32
dc.relation.alternativeid info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.1186/s13059-016-0883-6
dc.conicet.fuente unificacion


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