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dc.contributor.author
Almuzara, Marisa
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dc.contributor.author
Montaña, Sabrina Daiana
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dc.contributor.author
Lazzaro, Terese
dc.contributor.author
Uong, Sylvia
dc.contributor.author
Parmeciano Di Noto, Gisela Paula
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dc.contributor.author
Traglia, German Matias
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dc.contributor.author
Bakai, Romina
dc.contributor.author
Centron, Daniela
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dc.contributor.author
Iriarte Odini, Andrés
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dc.contributor.author
Quiroga, Cecilia
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dc.contributor.author
Ramirez, Maria Soledad
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dc.date.available
2018-06-06T17:57:08Z
dc.date.issued
2017-12
dc.identifier.citation
Almuzara, Marisa; Montaña, Sabrina Daiana; Lazzaro, Terese; Uong, Sylvia; Parmeciano Di Noto, Gisela Paula; et al.; Genetic analysis of a PER-2-producing Shewanella sp. strain harbouring a variety of mobile genetic elements and antibiotic resistance determinants; Elsevier; Journal of Global Antimicrobial Resistance; 11; 12-2017; 81-86
dc.identifier.issn
2213-7165
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/47514
dc.description.abstract
The objective of this study was to investigate the molecular mechanisms explaining the multidrug-resistant (MDR) phenotype found in a novel clinical Shewanella sp. strain (Shew256) recovered from a diabetic patient. Whole-genome shotgun sequencing was performed using Illumina MiSeq-I and Nextera XT DNA library. De novo assembly was performed with SPAdes. RAST Server was used to predict the open-reading frames and the predictions were confirmed using BLAST. Further genomic analysis was carried out using average nucleotide identity (ANI), ACT (Artemis), OrthoMCL, ARG-ANNOT, ISfinder, PHAST, tRNAscan-SE, plasmidSPAdes, PlasmidFinder and MAUVE. PCR and plasmid extraction were also performed. Genomic analysis revealed a total of 456 predicted genes unique to Shew256 compared with other Shewanella genomes. Moreover, the presence of different resistance genes, including blaPER-2, was found. A complex class 1 integron containing the ISCR1 gene, disrupted by two putative transposase genes, was identified. Furthermore, other resistance genes, a transposon containing aph(3′), insertion sequences, phages and non-coding RNAs were also found. In conclusion, evidence of acquisition of resistance genes and mobile elements that could explain the MDR phenotype were observed. This Shewanella sp. represents a prime example of how antibiotic resistance determinants can be acquired by uncommon pathogens.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
dc.subject
Shewanella
dc.subject
Draft Genome
dc.subject
Bla Per-2
dc.subject
Antimicrobial Resistance
dc.subject.classification
Otras Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Genetic analysis of a PER-2-producing Shewanella sp. strain harbouring a variety of mobile genetic elements and antibiotic resistance determinants
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2018-06-06T13:46:07Z
dc.journal.volume
11
dc.journal.pagination
81-86
dc.journal.pais
Países Bajos
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dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Almuzara, Marisa. Provincia de Buenos Aires. Ministerio de Salud. Hospital Interzonal de Agudos "Eva Perón"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Montaña, Sabrina Daiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Lazzaro, Terese. Universidad de la República; Uruguay
dc.description.fil
Fil: Uong, Sylvia. Universidad de la República; Uruguay
dc.description.fil
Fil: Parmeciano Di Noto, Gisela Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Traglia, German Matias. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Bakai, Romina. Provincia de Buenos Aires. Ministerio de Salud. Hospital Interzonal de Agudos "Eva Perón"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Centron, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Iriarte Odini, Andrés. Universidad de la República; Uruguay
dc.description.fil
Fil: Quiroga, Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Ramirez, Maria Soledad. Universidad de la República; Uruguay. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.journal.title
Journal of Global Antimicrobial Resistance
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://dx.doi.org/10.1016/j.jgar.2017.06.005
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2213716517301170
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