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dc.contributor.author
Carballido, Jessica Andrea
dc.contributor.author
Gallo, Cristian Andrés
dc.contributor.author
Dussaut, Julieta Sol
dc.contributor.author
Ponzoni, Ignacio
dc.date.available
2018-05-22T18:56:49Z
dc.date.issued
2015-07
dc.identifier.citation
Carballido, Jessica Andrea; Gallo, Cristian Andrés; Dussaut, Julieta Sol; Ponzoni, Ignacio; On Evolutionary Algorithms for Biclustering of Gene Expression Data; Bentham Science Publishers; Current Bioinformatics; 10; 3; 7-2015; 259-267
dc.identifier.issn
1574-8936
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/45891
dc.description.abstract
Past decades have seen the rapid development of microarray technologies making available large amounts of gene expression data. Hence, has become increasingly important to count with reliable methods that interpret this information in order to discover new biological knowledge. In this review paper we aim to describe the main existing evolutionary methods that analyze microarray gene expression data by means of biclustering techniques. Strategies will be classified according to the evaluation metric they use to quantify the quality of the biclusters. In this context, the main evaluation measures namely mean squared residue, virtual error and transposed virtual error are first presented. Then, the main evolutionary algorithms, which find biclusters in gene expression data matrices using those metrics, are described and compared.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Bentham Science Publishers
dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Evolutionary Algorithms
dc.subject
Biclustering
dc.subject
Gene Expression Data
dc.subject
Evaluation Metrics
dc.subject
Microarray Analysis
dc.subject
Regulatory Networks
dc.subject.classification
Ciencias de la Computación
dc.subject.classification
Ciencias de la Computación e Información
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
On Evolutionary Algorithms for Biclustering of Gene Expression Data
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2018-04-26T15:05:56Z
dc.journal.volume
10
dc.journal.number
3
dc.journal.pagination
259-267
dc.journal.pais
Estados Unidos
dc.journal.ciudad
Oak Park
dc.description.fil
Fil: Carballido, Jessica Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación; Argentina
dc.description.fil
Fil: Gallo, Cristian Andrés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación; Argentina
dc.description.fil
Fil: Dussaut, Julieta Sol. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación; Argentina
dc.description.fil
Fil: Ponzoni, Ignacio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación; Argentina
dc.journal.title
Current Bioinformatics
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.2174/1574893609666140829204739
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.eurekaselect.com/124284/article


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