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dc.contributor.author
Garcia, Carlos Fernando
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dc.contributor.author
Pedrini, Nicolás
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dc.contributor.author
Sánchez Paz, Arturo
dc.contributor.author
Reyna Blanco, Carlos S.
dc.contributor.author
Lavarias, Sabrina Maria Luisa
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dc.contributor.author
Muhlia Almazán, Adriana
dc.contributor.author
Fernandez Gimenez, Analia Veronica
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dc.contributor.author
Laino, Aldana
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dc.contributor.author
de la Re Vega, Enrique
dc.contributor.author
Lukaszewicz, Germán
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dc.contributor.author
López Zavala, Alonso A.
dc.contributor.author
Brieba, Luis G.
dc.contributor.author
Criscitello, Michael F.
dc.contributor.author
Carrasco Miranda, Jesús S.
dc.contributor.author
García Orozco, Karina D.
dc.contributor.author
Ochoa Leyva, Adrian
dc.contributor.author
Rudiño Piñera, Enrique
dc.contributor.author
Sanchez Flores, Alejandro
dc.contributor.author
Sotelo Mundo, Rogerio R.
dc.date.available
2018-04-24T20:08:39Z
dc.date.issued
2018-02
dc.identifier.citation
Garcia, Carlos Fernando; Pedrini, Nicolás; Sánchez Paz, Arturo; Reyna Blanco, Carlos S.; Lavarias, Sabrina Maria Luisa; et al.; De novo assembly and transcriptome characterization of the freshwater prawn Palaemonetes argentinus : Implications for a detoxification response; Elsevier Science; Marine Genomics; 37; 2-2018; 74-81
dc.identifier.issn
1874-7787
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/43345
dc.description.abstract
Palaemonetes argentinus, an abundant freshwater prawn species in the northern and central region of Argentina, has been used as a bioindicator of environmental pollutants as it displays a very high sensitivity to pollutants exposure. Despite their extraordinary ecological relevance, a lack of genomic information has hindered a more thorough understanding of the molecular mechanisms potentially involved in detoxification processes of this species. Thus, transcriptomic profiling studies represent a promising approach to overcome the limitations imposed by the lack of extensive genomic resources for P. argentinus, and may improve the understanding of its physiological and molecular response triggered by pollutants. This work represents the first comprehensive transcriptome-based characterization of the non-model species P. argentinus to generate functional genomic annotations and provides valuable resources for future genetic studies. Trinity de novo assembly consisted of 24,738 transcripts with high representation of detoxification (phase I and II), anti-oxidation, osmoregulation pathways and DNA replication and bioenergetics. This crustacean transcriptome provides valuable molecular information about detoxification and biochemical processes that could be applied as biomarkers in further ecotoxicology studies.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier Science
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Palaemonetes Argentinus
dc.subject
Shrimp
dc.subject
Prawn
dc.subject
Transcriptome
dc.subject
Detoxification
dc.subject
Crustacea
dc.subject.classification
Otras Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
De novo assembly and transcriptome characterization of the freshwater prawn Palaemonetes argentinus : Implications for a detoxification response
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2018-02-05T13:42:16Z
dc.journal.volume
37
dc.journal.pagination
74-81
dc.journal.pais
Países Bajos
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dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Garcia, Carlos Fernando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata "Prof. Dr. Rodolfo R. Brenner". Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata ; Argentina
dc.description.fil
Fil: Pedrini, Nicolás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata "Prof. Dr. Rodolfo R. Brenner". Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata ; Argentina
dc.description.fil
Fil: Sánchez Paz, Arturo. Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste; Argentina
dc.description.fil
Fil: Reyna Blanco, Carlos S.. Universidad Nacional Autónoma de México; México
dc.description.fil
Fil: Lavarias, Sabrina Maria Luisa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Limnología "Dr. Raúl A. Ringuelet". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Naturales y Museo. Instituto de Limnología; Argentina
dc.description.fil
Fil: Muhlia Almazán, Adriana. Laboratorio de Bioenergética, Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo; Argentina
dc.description.fil
Fil: Fernandez Gimenez, Analia Veronica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencia Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; Argentina
dc.description.fil
Fil: Laino, Aldana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata "Prof. Dr. Rodolfo R. Brenner". Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata ; Argentina
dc.description.fil
Fil: de la Re Vega, Enrique. Universidad de Sonora; México
dc.description.fil
Fil: Lukaszewicz, Germán. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencia Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; Argentina
dc.description.fil
Fil: López Zavala, Alonso A.. Universidad de Sonora; México
dc.description.fil
Fil: Brieba, Luis G.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencia Exactas y Naturales. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras; Argentina
dc.description.fil
Fil: Criscitello, Michael F.. Texas A&M University; Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Carrasco Miranda, Jesús S.. Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo; México
dc.description.fil
Fil: García Orozco, Karina D.. Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo; México
dc.description.fil
Fil: Ochoa Leyva, Adrian. Universidad Nacional Autónoma de México; México
dc.description.fil
Fil: Rudiño Piñera, Enrique. Universidad Nacional Autónoma de México; México
dc.description.fil
Fil: Sanchez Flores, Alejandro. Universidad Nacional Autónoma de México; México
dc.description.fil
Fil: Sotelo Mundo, Rogerio R.. Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo; México
dc.journal.title
Marine Genomics
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.1016/j.margen.2017.08.009
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1874778717301897
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