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dc.contributor.author
Aguirre, Natalia Cristina
dc.contributor.author
Filippi, Carla Valeria
dc.contributor.author
Vera, Pablo Alfredo
dc.contributor.author
Puebla, Andrea Fabiana
dc.contributor.author
Zaina, Giusi
dc.contributor.author
Lia, Veronica Viviana
dc.contributor.author
Marcucci Poltri, Susana Noemí
dc.contributor.author
Paniego, Norma Beatriz
dc.contributor.other
Shavrukov, Yuri
dc.date.available
2025-11-04T12:22:54Z
dc.date.issued
2023
dc.identifier.citation
Aguirre, Natalia Cristina; Filippi, Carla Valeria; Vera, Pablo Alfredo; Puebla, Andrea Fabiana; Zaina, Giusi; et al.; Double Digest Restriction-Site Associated DNA Sequencing (ddRADseq) Technology; Humana Press; 2638; 2023; 37-57
dc.identifier.isbn
978-1-0716-3024-2
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/274737
dc.description.abstract
Double digest restriction-site associated DNA sequencing (ddRADseq) technology combines genome reduced representation by digestion with two restriction enzymes and next generation sequencing (NGS) to obtain thousands of markers (SNP, SSR, and InDels) and genotype tens to hundreds of samples simultaneously. In this chapter, we describe a 96-plex derived ddRADseq protocol that can be set up to obtain different depth of coverage per locus and can be exploited to model and non-model plant species.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Humana Press
dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Reduced representation libraries
dc.subject
Next generation sequencing
dc.subject
RADseq
dc.subject
Genotyping by sequencing
dc.subject
SNP
dc.subject
SSR
dc.subject
InDels
dc.subject
Molecular markers
dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.subject.classification
Tecnología GM, clonación de ganado, selección asistida, diagnósticos, tecnología de producción de biomasa, etc.
dc.subject.classification
Biotecnología Agropecuaria
dc.subject.classification
CIENCIAS AGRÍCOLAS
dc.title
Double Digest Restriction-Site Associated DNA Sequencing (ddRADseq) Technology
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type
info:eu-repo/semantics/bookPart
dc.type
info:ar-repo/semantics/parte de libro
dc.date.updated
2024-12-02T13:47:15Z
dc.journal.volume
2638
dc.journal.pagination
37-57
dc.journal.pais
Estados Unidos
dc.journal.ciudad
New York
dc.description.fil
Fil: Aguirre, Natalia Cristina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Filippi, Carla Valeria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Universidad de la Republica. Facultad de Agricultura; Uruguay
dc.description.fil
Fil: Vera, Pablo Alfredo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Puebla, Andrea Fabiana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Zaina, Giusi. Università di Udine; Italia
dc.description.fil
Fil: Lia, Veronica Viviana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Marcucci Poltri, Susana Noemí. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Paniego, Norma Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.1007/978-1-0716-3024-2_4
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://link.springer.com/protocol/10.1007/978-1-0716-3024-2_4
dc.conicet.paginas
464
dc.source.titulo
Plant Genotyping: Methods and Protocols
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Tamaño:
379.0Kb
Formato:
PDF