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Datos de investigación

La conexión entre el microbioma y RAC3: un posible eje de biomarcadores para la progresión y el pronóstico del cáncer colorrectal

Autores: Bernacchia, Juliana LourdesIcon ; Costas, Monica AlejandraIcon
Publicador: Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
Fecha de depósito: 29/10/2025
Fecha de recolección: 26/06/2024-10/04/2025
Clasificación temática:
Otras Ciencias Médicas

Resumen

Antecedentes: La progresión del cáncer colorrectal (CCR) involucra factores genéticos, epigenéticos y del microbioma, donde el coactivador del receptor nuclear RAC3 desempeña un papel clave en el mantenimiento de las células madre cancerosas (CMC). Métodos: Analizamos la composición del microbioma en tejidos de CCR, estratificados según la expresión de RAC3, utilizando conjuntos de datos TCGA y realizamos infecciones in vitro de líneas celulares de CCR con bacterias fecales de pacientes. Resultados: La alta expresión de RAC3 se correlacionó con una firma microbiana distintiva, enriquecida en Verrucomicrobia (género Akkermansia), Desulfovibrio y Bilophila, junto con una menor expresión de mucina y un aumento de los marcadores de CCR, inestabilidad genómica y una menor supervivencia libre de enfermedad. Las bacterias fecales de pacientes con CCR indujeron la expresión de RAC3, la activación de NF-κB y la formación de tumoresferas en líneas celulares de CCR. Conclusiones: Estos hallazgos sugieren un eje microbioma-RAC3 que podría promover el mantenimiento de las CCR y la progresión del CCR, ofreciendo posibles dianas para el pronóstico y el tratamiento.

Información Técnica

Con el fin de explorar la diversidad taxonómica bacteriana asociada a los niveles de expresión de RAC3 en tejido colorrectal, realizamos un análisis bioinformático filtrando y seleccionando muestras secuenciadas del microbioma de CRC de conjuntos de datos públicos de la Universidad de Duke de tejidos descontaminados de sangre bacteriana. Filtramos y procesamos 524 muestras que contenían 429 tejidos tumorales y 95 normales e incluimos sus valores como metadatos de los datos de RAC3 RNAseq de Cancer Bioportal, correspondientes a cada una de las muestras (adenocarcinoma de colon TCGA-GDC y adenocarcinoma colorrectal TCGA-Pan cancer atlas). Se clasificaron como altos cuando el valor de la puntuación respecto al tejido normal fue superior a 1,6 (107 muestras), medios para aquellos inferiores a 1,6 y superiores a -0,6 (205 muestras) o bajos RAC3 para muestras inferiores a -0,6 valores de cambio de log fold respecto a las muestras normales (117 muestras). El análisis fue realizado por la plataforma Microbiome Analyst 2.0 (https://www.microbiomeanalyst.ca/MicrobiomeAnalyst/home.xhtml)
Palabras clave: COLORECTAL CANCER, MICROBIOME SIGNATURE, CANCER STEM CELL, RAC3 EXPRESSION
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Fin del embargo:
31-12-2025
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Identificador del recurso
URI: http://hdl.handle.net/11336/274195
Colecciones
Datos de Investigación(IDIM)
Datos de Investigación de INST.DE INVEST.MEDICAS
Citación
Bernacchia, Juliana Lourdes; Costas, Monica Alejandra; (2025): La conexión entre el microbioma y RAC3: un posible eje de biomarcadores para la progresión y el pronóstico del cáncer colorrectal. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/274195
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