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dc.date.available
2025-06-23T10:56:31Z
dc.identifier.citation
Pellegrino, Melina; Sánchez, Julieta; Chiberry, Lu Denisse; Victorio, Mariela Fernanda; Poljak, Sebastián; (2025): Mammal diversity in remote and harsh habitats: validating the power of environmental DNA metabarcoding at the southernmost tip of South America. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/264351
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/264351
dc.description.abstract
This data resource provides information on the diversity and distribution of mammals in the province of Tierra del Fuego, Antarctica, and the South Atlantic Islands, using the technique of environmental DNA metabarcoding in freshwater environments. It includes a reference database of the mitochondrial 12S rRNA gene, constructed from tools such as GenBank and de novo sequences from local mammals. Additionally, it features sequencing data generated with the Illumina MiSeq system.
dc.rights
info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.title
Mammal diversity in remote and harsh habitats: validating the power of environmental DNA metabarcoding at the southernmost tip of South America
dc.type
dataset
dc.date.updated
2025-06-23T10:51:00Z
dc.description.fil
Fil: Pellegrino, Melina. Universidad Nacional de Tierra del Fuego. Instituto de Ciencias Polares, Recursos Naturales y Ambiente; Argentina
dc.description.fil
Fil: Sánchez, Julieta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Austral de Investigaciones Científicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Chiberry, Lu Denisse. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Austral de Investigaciones Científicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Victorio, Mariela Fernanda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Austral de Investigaciones Científicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Poljak, Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Austral de Investigaciones Científicas; Argentina. Universidad Nacional de Tierra del Fuego, Antártida e Islas del Atlántico Sur. Instituto de Ciencias Polares, Recursos Naturales y Ambiente. Departamento de Biología; Argentina
dc.rights.embargoDate
2026-01-01
dc.datacite.PublicationYear
2025
dc.datacite.Creator
Pellegrino, Melina
dc.datacite.Creator
Sánchez, Julieta
dc.datacite.Creator
Chiberry, Lu Denisse
dc.datacite.Creator
Victorio, Mariela Fernanda
dc.datacite.Creator
Poljak, Sebastián
dc.datacite.affiliation
Universidad Nacional de Tierra del Fuego. Instituto de Ciencias Polares, Recursos Naturales y Ambiente
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Austral de Investigaciones Científicas
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Austral de Investigaciones Científicas
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Austral de Investigaciones Científicas
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Austral de Investigaciones Científicas
dc.datacite.affiliation
Universidad Nacional de Tierra del Fuego, Antártida e Islas del Atlántico Sur. Instituto de Ciencias Polares, Recursos Naturales y Ambiente. Departamento de Biología
dc.datacite.publisher
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
dc.datacite.subject
Conservación de la Biodiversidad
dc.datacite.subject
Ciencias Biológicas
dc.datacite.subject
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.datacite.date
16/04/2024-16/04/2024
dc.datacite.DateType
Recolectado
dc.datacite.language
eng
dc.datacite.version
1.0
dc.datacite.description
A local database of 12S rRNA (12S) gene sequences was generated for mammal species present in Tierra del Fuego. Some of these sequences were obtained from the GenBank genetic database, while sequences for species with no available information were generated from tissue samples stored in the sample bank of the Molecular Ecology Laboratory at the Austral Centre for Scientific Research (CADIC-CONICET). DNA amplification was performed using the 12S primers XL: 5'-AAAGCGAGGCACTGAAAATG-3' and XH: 5'-GGTGTAAGCCGGATGCTTT-3' (Poljak, unpublished), resulting in a 770 base pair (bp) fragment of the 12S region. Five sampling sites were selected across the province: the Grande River, located in the Magellanic Steppe region; the Ewan River, within the Ecotone; and the Milna, Lasifashaj, and Olivia Rivers, situated in the Andean Cordillera. Finally, eDNA extraction was followed by high-throughput sequencing using the Illumina MiSeq platform.
dc.datacite.DescriptionType
Métodos
dc.datacite.FundingReference
11220210100691CO
dc.datacite.FundingReference
630
dc.datacite.FunderName
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
dc.datacite.FunderName
FUNDACIÓN WILLIAMS
dc.subject.keyword
eDNA
dc.subject.keyword
Metabarcoding
dc.subject.keyword
Conservation
dc.subject.keyword
Tierra del Fuego
dc.datacite.resourceTypeGeneral
dataset
dc.conicet.datoinvestigacionid
27806
dc.datacite.awardTitle
PIP
dc.datacite.awardTitle
Project
dc.datacite.geolocation
Tierra del Fuego, Antártida e Islas del Atlántico Sur
dc.datacite.formatedDate
2024
Archivos del conjunto de datos
Archivo
Notas de uso
Tamaño
Mimmalreads.zip
Embargado hasta 01-01-2026
277.7Mb
12S_Mimammal_MarVel.txt
Embargado hasta 01-01-2026
578.6Kb
Sequencing_sample_sites.xlsx
Embargado hasta 01-01-2026
9.987Kb