La supresión del CCI no afecta la estructura de la comunidad fúngica de girasol

Abstract

Es escasa la información referente a los efectos que los manejos aplicados al cultivo de cobertura invernal (CCI) pueden ocasionar sobre el microbioma rizosférico del cultivo sucesor. En particular, los CCI pueden compartir hongos patógenos con el cultivo principal ya sea como “puentes verdes” o “puentes marrones”, actuando como hospedadores, aún sin desarrollar síntomas visibles. Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue analizar la estructura de la comunidad de hongos en la rizosfera de girasol (Helianthus annuus L.) en respuesta al método de supresión del CCI antecesor y a la fertilización fosforada. El ensayo se realizó en parcelas con un diseño en bloques completos aleatorizados con cuatro repeticiones, a lo largo de dos campañas agrícolas (2018/19 y 2019/20). Dieciséis parcelas se sembraron con avena (Avena sativa L., como CCI) y cuatro parcelas se mantuvieron con barbecho. El CCI se suprimió mediante acción mecánica (R, rolo faca de tiro manual) o química (DQ, glifosato), mientras que en las parcelas con barbecho se aplicó glifosato para el control de vegetación espontánea. A los 13 días de la supresión del CCI se realizó la siembra de un híbrido de girasol, aplicando 30 kg ha-1 de fosfato diamónico a la mitad de las parcelas roladas (RP) y desecadas químicamente (DQP) y a las parcelas que se destinaron a barbecho (BP). Se tomaron muestras de suelo rizosférico en estado vegetativo y se extrajo el ADN metagenómico para su análisis mediante secuenciación de la región ITS para hongos con la plataforma MiSeq (Illumina) y análisis de secuencias con QIIME2. Los datos se ingresaron luego en la plataforma de detección de predictores JMP® (SAS Institute Inc.) y los géneros seleccionados se analizaron por modelos mixtos con el software estadístico SAS, previa aplicación de la transformación centered-log ratio. El ordenamiento mediante NMDS con distancia UniFrac generalizada no mostró una separación de las comunidades en respuesta a los diferentes tratamientos. Asimismo, los géneros fúngicos no mostraron un efecto significativo del tratamiento (ANOVA, P>0,05). Sin embargo, se observaron diferencias significativas para los índices de riqueza de especies. La riqueza estimada (Chao-1) fue menor en BP con respecto a DQ (con o sin P) y RP, mientras que R tuvo una menor riqueza que RP. En tanto, la riqueza observada (ASVs observados) fue menor en BP respecto de RP, pero no se diferenció del resto de los tratamientos. Los resultados demuestran que la supresión del CCI no ejerce una influencia diferencial sobre las comunidades fúngicas del cultivo sucesor en estadios tempranos. No obstante, deberían ser confirmados con análisis del microbioma de raíces en estadios más avanzado y con estudios donde esta rotación se mantenga por más largo plazo.