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dc.contributor.author
Aulicino, Paula
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dc.contributor.author
Gómez Carrillo, Manuel
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dc.contributor.author
Bello, Gonzalo
dc.contributor.author
Rocco, Carlos
dc.contributor.author
Mangano, Andrea María Mercedes
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dc.contributor.author
Carr, Jean
dc.contributor.author
Sen, Luisa
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dc.contributor.author
Foley, Brian
dc.date.available
2024-08-28T15:12:58Z
dc.date.issued
2012-03
dc.identifier.citation
Aulicino, Paula; Gómez Carrillo, Manuel; Bello, Gonzalo; Rocco, Carlos; Mangano, Andrea María Mercedes; et al.; Characterization of full-length HIV-1 CRF17_BF genomes and comparison to the prototype CRF12_BF strains; Elsevier Science; Infection, Genetics and Evolution; 12; 2; 3-2012; 443-447
dc.identifier.issn
1567-1348
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/243264
dc.description.abstract
The aim of this work is to characterize the full-length intersubtype recombinant structure of the HIV-1 Circulating Recombinant Form CRF17_BF. A single genome of CRF17_BF was originally described in 2001 as being largely similar to CRF12_BF. Since then, more genomes of CRF17_BF have been sequenced but not adequately described in publications. Here we describe CRF17_BF as a genuine CRF, and analyze its recombination pattern based on bootscan analyses, subtype signature patterns, and phylogenetic reconstruction of subtype-delimited segments. We show that CRF17_BF can be distinguished from CRF12_BF in several regions of the genome, including vpu, pol, env and nef. A complete and accurate characterization and description of recombination breakpoints in CRFs is required for a proper surveillance of HIV-1 genotypes, and important for epidemiological purposes.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier Science
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
HIV-1
dc.subject
CRF
dc.subject
HIV-1
dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
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dc.subject.classification
Medicina Básica
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dc.subject.classification
CIENCIAS MÉDICAS Y DE LA SALUD
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dc.title
Characterization of full-length HIV-1 CRF17_BF genomes and comparison to the prototype CRF12_BF strains
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2024-08-28T09:53:10Z
dc.journal.volume
12
dc.journal.number
2
dc.journal.pagination
443-447
dc.journal.pais
Países Bajos
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dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Aulicino, Paula. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Gómez Carrillo, Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida; Argentina
dc.description.fil
Fil: Bello, Gonzalo. Ministerio de Salud de Brasil. Fundación Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz;
dc.description.fil
Fil: Rocco, Carlos. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Mangano, Andrea María Mercedes. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Carr, Jean. University of Maryland; Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Sen, Luisa. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Pediatría "Juan P. Garrahan"; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Foley, Brian. Los Alamos National High Magnetic Field Laboratory; Estados Unidos
dc.journal.title
Infection, Genetics and Evolution
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1567134812000044
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2012.01.003
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