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dc.contributor.author
Gitman, Iván Federico Berco
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dc.contributor.author
Martinez Moyano, Edgar
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dc.contributor.author
Grossi, Cecilia Eugenia María
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dc.contributor.author
Ulloa, Rita Maria
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dc.date.available
2024-07-25T10:59:26Z
dc.date.issued
2023
dc.identifier.citation
Expression analysis of Protease inhibitors in potato plants exposed to different environmental conditions; LVIII Annual Meeting of the Argentine Society for Biochemistry and Molecular Biology Research; Mendoza; Argentina; 2022; 1-1
dc.identifier.issn
0327-9545
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/240813
dc.description.abstract
Analysis of the potato genome (SPUD DB) allowed us to identify 142 protease inhibitors (PIs); 42 PI genes are clustered in tandem in chr.3, position 43 Mbp (3.43): 14 encode Kunitz-type PIs (KTIs), 4 encode trypsin type PIs (TPI) and 1 encodes a cystein PI (CPI), and at position 48 MBp (3.48), 10 genes encode KTIs, 8 encode PIN-II and 5 encode serine type PI (PIN-I). On the other hand, 11 genes encoding 5 KTIs, 3 cystatin B, and 3 PIN-I are grouped in Chr. 6, and 12 PIN-I genes are in chr. 9. This multigene family regulates protein turn-over preventing catabolism of essential proteins during metabolic processes and plays a role in the defense against heterologous proteases from pathogens and pests. PIs have been proposed as an alternative to chemical pesticides for the control of herbivorous insects, and as abiotic stress-protective factors. Degenerate primers were designed against five PIs (Soltu.DM.03G018480, -G018520, -G018580, - G018620, -G018650) of 3.43, seven PIs (Soltu.DM.03G023490, -G023500, -G23510, -G23520, -G23530, - G23540, and -G024110) of 3.48, and seven PIs of Chr. 9 (Soltu.DM.09G025840, -G025850 -G025860 - G025880, -G025900, -G025910, and -G025930) that share at least 83.46, 55,2 and 77,53 % of nucleotide identity. According to RNAseq data these three gene clusters are induced upon drought, salt, mannitol and N2 fertilization, and are downregulated during tuber dormancy release. To confirm the RNAseq data, RT-qPCR assays were performed using RNAs from in-vitro plants cultured under control conditions or a) with different NH4+ and NO3- concentrations, b) exposed during 1 week to continuous darkness, and c) to 150 mM NaCl during 24 and 96 h. In addition, RNA was extracted from greenhouse plants exposed to drought conditions. To analyze, the role of PIs during source-sink processes, RNA was obtained from dormant and sprouting tubers, from etiolated and green sprouts, and from young, fully developed and senescent leaves. In the future we aim to characterize one gene of each cluster in overexpressing or knockdown plants to elucidate their potential as biotechnological tools.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Tech Science Press
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
PROTEASE INHIBITORS
dc.subject
POTATO
dc.subject
STRESS RESPONSE
dc.subject
BIOTECHNOLOGY
dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Expression analysis of Protease inhibitors in potato plants exposed to different environmental conditions
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type
info:eu-repo/semantics/conferenceObject
dc.type
info:ar-repo/semantics/documento de conferencia
dc.date.updated
2024-06-25T15:12:19Z
dc.identifier.eissn
1667-5746
dc.journal.volume
47
dc.journal.number
Supl. 1
dc.journal.pagination
1-1
dc.journal.pais
Estados Unidos
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dc.journal.ciudad
Henderson
dc.description.fil
Fil: Gitman, Iván Federico Berco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Martinez Moyano, Edgar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Grossi, Cecilia Eugenia María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Ulloa, Rita Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.techscience.com/biocell/v47nSuppl.1/50703/pdf
dc.conicet.rol
Autor
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Autor
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dc.coverage
Nacional
dc.type.subtype
Reunión
dc.description.nombreEvento
LVIII Annual Meeting of the Argentine Society for Biochemistry and Molecular Biology Research
dc.date.evento
2022-11-08
dc.description.ciudadEvento
Mendoza
dc.description.paisEvento
Argentina
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dc.type.publicacion
Journal
dc.description.institucionOrganizadora
Sociedad Argentina de Investigaciones en Bioquímica y Biología Molecular
dc.source.revista
Biocell
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dc.date.eventoHasta
2022-11-11
dc.type
Reunión
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