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dc.contributor.author Mondino, Eduardo
dc.contributor.author Covacevich, Fernanda
dc.contributor.author Studdert, Guillermo Alberto
dc.contributor.author Pimentel, João
dc.contributor.author Berbara, Ricardo L. L.
dc.coverage.spatial Argentina, Región Pampeana
dc.date.available 2017-08-18T20:49:13Z
dc.date.issued 2015-06
dc.identifier.citation Mondino, Eduardo; Covacevich, Fernanda; Studdert, Guillermo Alberto; Pimentel, João; Berbara, Ricardo L. L.; Extracting DNA of nematodes communities from Argentine Pampas agricultural soils; Academia Brasileira de Ciencias; Anais da Academia Brasileira de Ciencias; 87; 2; 6-2015; 691-697
dc.identifier.issn 0001-3765
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11336/22712
dc.description.abstract We examined four strategies (Tris/EDTA, sodium dodecyl sulfate, Chelex 100 resin and cetyltrimethylammonium bromide -CTAB-) for extracting nucleic acid (DNA) from communities of nematodes. Nematodes were isolated from an agricultural area under different management of long-term crop rotation experiment from Argentina during three seasons. After DNA extraction, Polymerase Chain Reaction-amplifications were performed and considered as indicators of successful DNA extraction. The CTAB combined with proteinase K and phenol-chloroform-isoamyl alcohol was the unique successful method because positive amplifications were obtained by using both eukaryotic and nematode specific primers. This work could contribute to biodiversity studies of nematodes on agroecosystems.
dc.description.abstract Foram examinadas quatro estratégias (Tris / EDTA, dodecilsulfato de sódio, resina Chelex 100 e brometo de cetiltrimetilamónio -CTAB-) para a extração de ácido nucleico (DNA) das comunidades de nematóides. Os nematóides foram isolados a partir de uma área agrícola sob manejo diferente num experimento de rotação de culturas de longo prazo, durante três temporadas na Argentina. Após a extração de DNA, a reação em cadeia da polimerase e amplificações foram realizadas e consideradas como indicadoras da extração de DNA com sucesso. O CTAB combinada com proteinase K e álcool fenol-clorofórmio-isoamílico foi o único método bem sucedido porque as amplificações positivas foram obtidas utilizando ambos os primers específicos para os eucariótas e nematóides. Este trabalho poderá contribuir para o estudo da biodiversidade de nematóides em agroecossistemas.
dc.format application/pdf
dc.language.iso eng
dc.publisher Academia Brasileira de Ciencias
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject soil nematofauna
dc.subject nucleic acid nucleotid extraction
dc.subject CTAB
dc.subject Agroeconsystems
dc.subject nematodes
dc.subject.classification Bioquímica y Biología Molecular
dc.subject.classification Ciencias Biológicas
dc.subject.classification CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title Extracting DNA of nematodes communities from Argentine Pampas agricultural soils
dc.type info:eu-repo/semantics/article
dc.type info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated 2017-07-27T12:25:18Z
dc.identifier.eissn 1678-2690
dc.journal.volume 87
dc.journal.number 2
dc.journal.pagination 691-697
dc.journal.pais Brasil
dc.journal.ciudad Rio de Janeiro
dc.description.fil Fil: Mondino, Eduardo. Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Instituto de Agronomía; Brasil
dc.description.fil Fil: Covacevich, Fernanda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones En Biodiversidad y Biotecnología; Argentina. Fundación para Investigaciones Biológicas Aplicadas; Argentina
dc.description.fil Fil: Studdert, Guillermo Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria; Argentina
dc.description.fil Fil: Pimentel, João. Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Departamento de Entomologia e Fitopatologia. Instituto de Biologia; Brasil
dc.description.fil Fil: Berbara, Ricardo L. L.. Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Instituto de Agronomía; Brasil
dc.journal.title Anais da Academia Brasileira de Ciencias
dc.relation.alternativeid info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://ref.scielo.org/g9jzv3


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