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dc.contributor.author
Mondino, Eduardo
dc.contributor.author
Covacevich, Fernanda
dc.contributor.author
Studdert, Guillermo Alberto
dc.contributor.author
Pimentel, João
dc.contributor.author
Berbara, Ricardo L. L.
dc.coverage.spatial
Argentina, Región Pampeana
dc.date.available
2017-08-18T20:49:13Z
dc.date.issued
2015-06
dc.identifier.citation
Mondino, Eduardo; Covacevich, Fernanda; Studdert, Guillermo Alberto; Pimentel, João; Berbara, Ricardo L. L.; Extracting DNA of nematodes communities from Argentine Pampas agricultural soils; Academia Brasileira de Ciencias; Anais da Academia Brasileira de Ciencias; 87; 2; 6-2015; 691-697
dc.identifier.issn
0001-3765
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/22712
dc.description.abstract
We examined four strategies (Tris/EDTA, sodium dodecyl sulfate, Chelex 100 resin and cetyltrimethylammonium bromide -CTAB-) for extracting nucleic acid (DNA) from communities of nematodes. Nematodes were isolated from an agricultural area under different management of long-term crop rotation experiment from Argentina during three seasons. After DNA extraction, Polymerase Chain Reaction-amplifications were performed and considered as indicators of successful DNA extraction. The CTAB combined with proteinase K and phenol-chloroform-isoamyl alcohol was the unique successful method because positive amplifications were obtained by using both eukaryotic and nematode specific primers. This work could contribute to biodiversity studies of nematodes on agroecosystems.
dc.description.abstract
Foram examinadas quatro estratégias (Tris / EDTA, dodecilsulfato de sódio, resina Chelex 100 e brometo de cetiltrimetilamónio -CTAB-) para a extração de ácido nucleico (DNA) das comunidades de nematóides. Os nematóides foram isolados a partir de uma área agrícola sob manejo diferente num experimento de rotação de culturas de longo prazo, durante três temporadas na Argentina. Após a extração de DNA, a reação em cadeia da polimerase e amplificações foram realizadas e consideradas como indicadoras da extração de DNA com sucesso. O CTAB combinada com proteinase K e álcool fenol-clorofórmio-isoamílico foi o único método bem sucedido porque as amplificações positivas foram obtidas utilizando ambos os primers específicos para os eucariótas e nematóides. Este trabalho poderá contribuir para o estudo da biodiversidade de nematóides em agroecossistemas.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Academia Brasileira de Ciencias
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Soil Nematofauna
dc.subject
Nucleic Acid Nucleotid Extraction
dc.subject
Ctab
dc.subject
Agroeconsystems
dc.subject
Nematodes
dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
Extracting DNA of nematodes communities from Argentine Pampas agricultural soils
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2017-07-27T12:25:18Z
dc.identifier.eissn
1678-2690
dc.journal.volume
87
dc.journal.number
2
dc.journal.pagination
691-697
dc.journal.pais
Brasil
dc.journal.ciudad
Rio de Janeiro
dc.description.fil
Fil: Mondino, Eduardo. Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Instituto de Agronomía; Brasil
dc.description.fil
Fil: Covacevich, Fernanda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Investigaciones En Biodiversidad y Biotecnología; Argentina. Fundación para Investigaciones Biológicas Aplicadas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Studdert, Guillermo Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria; Argentina
dc.description.fil
Fil: Pimentel, João. Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Departamento de Entomologia e Fitopatologia. Instituto de Biologia; Brasil
dc.description.fil
Fil: Berbara, Ricardo L. L.. Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Instituto de Agronomía; Brasil
dc.journal.title
Anais da Academia Brasileira de Ciencias
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://ref.scielo.org/g9jzv3


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