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dc.contributor.author
Franco, Bruno Agustín
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dc.contributor.author
Luciano, Ezequiel Rodrigo
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dc.contributor.author
Sarotti, Ariel Marcelo
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dc.contributor.author
Zanardi, Maria Marta
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dc.date.available
2024-01-24T15:12:43Z
dc.date.issued
2023-09
dc.identifier.citation
Franco, Bruno Agustín; Luciano, Ezequiel Rodrigo; Sarotti, Ariel Marcelo; Zanardi, Maria Marta; DP4+App: Finding the Best Balance between Computational Cost and Predictive Capacity in the Structure Elucidation Process by DP4+. Factors Analysis and Automation; American Chemical Society; Journal of Natural Products; 86; 10; 9-2023; 2360-2367
dc.identifier.issn
0163-3864
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/224709
dc.description.abstract
DP4+ is one of the most popular methods for the structure elucidation of natural products using NMR calculations. While the method is simple and easy to implement, it requires a series of procedures that can be tedious, coupled with the fact that its computational demand can be high in certain cases. In this work, we made a substantial improvement to these limitations. First, we deeply explored the effect of molecular mechanics architecture on the DP4+ formalism (MM-DP4+). In addition, a Python applet (DP4+App) was developed to automate the entire process, requiring only the Gaussian NMR output files and a spreadsheet containing the experimental NMR data and labels. The script is designed to use the statistical parameters from the original 24 levels of theory (employing B3LYP/6-31G* geometries) and the new 36 levels explored in this work (over MMFF geometries). Furthermore, it enables the development of customizable methods using any desired level of theory, allowing for a free choice of test molecules.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
American Chemical Society
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
STRUCTURAL ELUCIDATION
dc.subject
NMR
dc.subject
COMPUTATIONAL CHEMISTRY
dc.subject.classification
Química Orgánica
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dc.subject.classification
Ciencias Químicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
DP4+App: Finding the Best Balance between Computational Cost and Predictive Capacity in the Structure Elucidation Process by DP4+. Factors Analysis and Automation
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2024-01-22T12:43:31Z
dc.journal.volume
86
dc.journal.number
10
dc.journal.pagination
2360-2367
dc.journal.pais
Estados Unidos
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dc.description.fil
Fil: Franco, Bruno Agustín. Pontificia Universidad Católica Argentina "Santa María de los Buenos Aires". Facultad de Química e Ingeniería-Rosario; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Luciano, Ezequiel Rodrigo. Pontificia Universidad Católica Argentina "Santa María de los Buenos Aires". Facultad de Química e Ingeniería-Rosario; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Sarotti, Ariel Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Química Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Química Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Zanardi, Maria Marta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina. Pontificia Universidad Católica Argentina "Santa María de los Buenos Aires". Facultad de Química e Ingeniería-Rosario; Argentina
dc.journal.title
Journal of Natural Products
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jnatprod.3c00566
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1021/acs.jnatprod.3c00566
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