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Artículo

LIDeB Tools: A Latin American resource of freely available, open-source cheminformatics apps

Prada Gori, Denis NihuelIcon ; Alberca, Lucas NicolásIcon ; Rodríguez, SantiagoIcon ; Alice, Juan IgnacioIcon ; Llanos, ManuelIcon ; Bellera, Carolina LeticiaIcon ; Talevi, AlanIcon
Fecha de publicación: 12/2022
Editorial: Elsevier
Revista: Artificial Intelligence in the Life Sciences
ISSN: 2667-3185
Idioma: Inglés
Tipo de recurso: Artículo publicado
Clasificación temática:
Métodos de Investigación en Bioquímica

Resumen

Cheminformatics is the chemical field that deals with the storage, retrieval, analysis and manipulation of an increasing volume of available chemical data, and it plays a fundamental role in the fields of drug discovery, biology, chemistry, and biochemistry. Open source and freely available cheminformatics tools not only contribute to the generation of public knowledge, but also to reduce the technological gap between high- and low- to middle-income countries. Here, we describe a series of in-house cheminformatics applications developed by our academic drug discovery team, which are freely available on our website (https://lideb.biol.unlp.edu.ar/) as Web Apps and stand-alone versions. These apps include tools for clustering small molecules, decoy generation, druggability assessment, classificatory model evaluation, and data standardization and visualization.
Palabras clave: CHEMINFORMATICS , OPEN SOURCE , WEB APPLICATIONS , CLUSTERING , DECOY GENERATION , DECOYS , DRUGGABILITY PREDICTION , DRUGGABILITY
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info:eu-repo/semantics/openAccess Excepto donde se diga explícitamente, este item se publica bajo la siguiente descripción: Creative Commons Attribution 2.5 Unported (CC BY 2.5)
Identificadores
URI: http://hdl.handle.net/11336/212085
URL: https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S2667318522000198
DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.ailsci.2022.100049
Colecciones
Articulos(CCT - LA PLATA)
Articulos de CTRO.CIENTIFICO TECNOL.CONICET - LA PLATA
Articulos(INIBIOLP)
Articulos de INST.DE INVEST.BIOQUIMICAS DE LA PLATA
Citación
Prada Gori, Denis Nihuel; Alberca, Lucas Nicolás; Rodríguez, Santiago; Alice, Juan Ignacio; Llanos, Manuel; et al.; LIDeB Tools: A Latin American resource of freely available, open-source cheminformatics apps; Elsevier; Artificial Intelligence in the Life Sciences; 2; 12-2022; 1-11
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