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dc.contributor.author
Debernardi, Juan Manuel
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dc.contributor.author
Rodriguez Virasoro, Ramiro Esteban
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dc.contributor.author
Mecchia, Martin Alejandro
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dc.contributor.author
Palatnik, Javier Fernando
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dc.date.available
2017-07-21T22:12:05Z
dc.date.issued
2012-01
dc.identifier.citation
Debernardi, Juan Manuel; Rodriguez Virasoro, Ramiro Esteban; Mecchia, Martin Alejandro; Palatnik, Javier Fernando; Functional specialization of the plant miR396 regulatory network through distinct microRNA-target interactions; Public Library Of Science; Plos Genetics; 8; 1; 1-2012; 1-14; e1002419
dc.identifier.issn
1553-7390
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/21143
dc.description.abstract
MicroRNAs (miRNAs) are ,21 nt small RNAs that regulate gene expression in animals and plants. They can be grouped into families comprising different genes encoding similar or identical mature miRNAs. Several miRNA families are deeply conserved in plant lineages and regulate key aspects of plant development, hormone signaling, and stress response. The ancient miRNA miR396 regulates conserved targets belonging to the GROWTH-REGULATING FACTOR (GRF) family of transcription factors, which are known to control cell proliferation in Arabidopsis leaves. In this work, we characterized the regulation of an additional target for miR396, the transcription factor bHLH74, that is necessary for Arabidopsis normal development. bHLH74 homologs with a miR396 target site could only be detected in the sister families Brassicaceae and Cleomaceae. Still, bHLH74 repression by miR396 is required for margin and vein pattern formation of Arabidopsis leaves. MiR396 contributes to the spatio-temporal regulation of GRF and bHLH74 expression during leaf development. Furthermore, a survey of miR396 sequences in different species showed variations in the 59 portion of the miRNA, a region known to be important for miRNA activity. Analysis of different miR396 variants in Arabidopsis thaliana revealed that they have an enhanced activity toward GRF transcription factors. The interaction between the GRF target site and miR396 has a bulge between positions 7 and 8 of the miRNA. Our data indicate that such bulge modulates the strength of the miR396-mediated repression and that this modulation is essential to shape the precise spatio-temporal pattern of GRF2 expression. The results show that ancient miRNAs can regulate conserved targets with varied efficiency in different species, and we further propose that they could acquire new targets whose control might also be biologically relevant.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Public Library Of Science
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Microrna
dc.subject
Evolution
dc.subject
Mir396
dc.subject
Function
dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Functional specialization of the plant miR396 regulatory network through distinct microRNA-target interactions
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2016-11-17T16:03:48Z
dc.journal.volume
8
dc.journal.number
1
dc.journal.pagination
1-14; e1002419
dc.journal.pais
Estados Unidos
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dc.journal.ciudad
San Francisco
dc.description.fil
Fil: Debernardi, Juan Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Rodriguez Virasoro, Ramiro Esteban. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Mecchia, Martin Alejandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Palatnik, Javier Fernando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.journal.title
Plos Genetics
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.1002419
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1002419
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