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dc.contributor.author
Refojo, Nicolás
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dc.contributor.author
Hevia, Alejandra Ines
dc.contributor.author
Abrantes, Ruben Antonio
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dc.contributor.author
Fernández, Julian
dc.contributor.author
Mazzetti, Agostina Paola
dc.contributor.author
Davel, Graciela Odelsia
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Iannone, Leopoldo Javier
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Canteros, Cristina Elena
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dc.date.available
2023-06-07T10:23:55Z
dc.date.issued
2018
dc.identifier.citation
Diagnóstico molecular de la infección fúngica invasora; VIII Congreso de la Sociedad Argentina de Bacteriología, Micología y Parasitología Clínicas; II Jornada de Micología Clínica y I Jornada de Parasitología Clínica; Buenos Aires; Argentina; 2018; 1-3
dc.identifier.isbn
978-987-46701-2-0
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/199798
dc.description.abstract
El diagnóstico rápido y la identificación de los agentes de infecciones fúngicas invasoras (IFI) es imperativo en pacientes oncohematológicos y trasplantados de órganos sólidos puesto que condicionan el tratamiento. El diagnóstico micológico molecular independiente de cultivo resulta de gran utilidad para detectar un amplio rango de especies causales.El objetivo de este estudio fue evaluar la utilidad de una PCR que amplifica el fragmento ITS2 y su posterior secuenciación para detectar ADN fúngico e identificar el agente causal en muestras clínicas.Se analizaron 135 muestras clínicas de 85 pacientes: 48 pacientes sin IFI o con IFI posible pero sin ningún hallazgo microbiológico y 37 muestras de pacientes con IFI probable o probada, según los criterios EORTC/MSG. Las muestras fueron: 79 de origen respiratorio en 56 pacientes y 56 de otros tejidos y/o líquidos de cavidades de 36 pacientes.Para detectar ADN fúngico se utilizó una PCR estandarizada en un estudio previo (limite de detección 1-2 UFC/mg) que amplifica la región ITS2.El ADN fue extraído con el equipo QIAamp DNA Blood&Tissue (Qiagen), previo tratamiento con liticasa. El ADN de cada muestra clínica fue evaluado concentrado y diluido 1/2 y 1/8, para disminuir el efecto de posibles inhibidores. En cada prueba se incluyó: un control de amplificación (tubo con DNA de A. fumigatus), un control negativo (agua) y un control de inhibición donde se amplificó el gen de la Beta globina humana.Cuando se obtuvo producto de amplificación, este fue purificado y secuenciado en un secuenciador Genetic Analyzer 3500. Para identificar la especie fúngica las secuencias fueron comparadas con las incluidas en las base de datos publica del GenBank utilizando el software BLASTn.La PCR amplificó ADN en muestras de 26 pacientes con IFI y en 8 sin IFI (falsos positivos). Entre estos 8 pacientes, en dos casos la banda amplificada fue débil y no se pudo secuenciar, mientras que las secuencias restantes no fueron de especies fúngicas. En 46 pacientes la PCR fue negativa, y 9 de estos pacientes tenían IFI confirmada por otra metodología (falsos negativos). Los 5 pacientes restantes se excluyeron del análisis porque la PCR fue inhibida.La PCR tuvo 74,3% de sensibilidad (S), 82,2% de especificidad (E) y valor predictivo positivo (VPP) y negativo (VPN) de 76,5% y 80,4%, respectivamente. La secuenciación permitió identificar: Aspergillus S. flavi en 3 casos, Aspergillus S. fumigati en 3, Aspergillus S. nigri en 2, Fusarium sp. en 2, y los siguientes hongos: Candida albicans, A. tamarii, Mucor sp., Rhizopus sp., Rizomucor sp., Penicillium sp., Scedosporium sp., Schizophyllum sp., Saksenaea sp., Exserohilum/Alternaria/Curvularia, Lasiodiplodiasp., C. usitaniae y C. glabrata en 1 casocada uno. En un paciente se detectó ADN de A. S. flavi y C. albicans en pulmón y C. albicans en LCR. En 8 pacientes fue posible identificar el agente en ausencia de cultivos.Esta técnica ensaya tuvo altos valores de S, E, VPN y VPP y permitió identificar los agentes de IFI en ausencia de cultivos.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
spa
dc.publisher
Asociación Argentina de Microbiología
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
PCR
dc.subject
ITS
dc.subject
DIAGNOSTICO
dc.subject
MICOSIS
dc.subject.classification
Micología
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Diagnóstico molecular de la infección fúngica invasora
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type
info:eu-repo/semantics/conferenceObject
dc.type
info:ar-repo/semantics/documento de conferencia
dc.date.updated
2022-11-25T00:29:41Z
dc.journal.pagination
1-3
dc.journal.pais
Argentina
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dc.journal.ciudad
Buenos Aires
dc.description.fil
Fil: Refojo, Nicolás. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Hevia, Alejandra Ines. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Abrantes, Ruben Antonio. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Fernández, Julian. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Mazzetti, Agostina Paola. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Davel, Graciela Odelsia. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Iannone, Leopoldo Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Micología y Botánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Micología y Botánica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Canteros, Cristina Elena. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; Argentina
dc.conicet.rol
Autor
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dc.coverage
Nacional
dc.type.subtype
Congreso
dc.description.nombreEvento
VIII Congreso de la Sociedad Argentina de Bacteriología, Micología y Parasitología Clínicas; II Jornada de Micología Clínica y I Jornada de Parasitología Clínica
dc.date.evento
2018-11-06
dc.description.ciudadEvento
Buenos Aires
dc.description.paisEvento
Argentina
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dc.type.publicacion
Book
dc.description.institucionOrganizadora
Sociedad Argentina de Bacteriología, Micología y Parasitología Clínicas
dc.description.institucionOrganizadora
Asociación Argentina de Microbiología
dc.source.libro
Libro de Resúmenes: VIII Congreso de la Sociedad Argentina de Bacteriología, Micología y Parasitología Clínicas; II Jornada de Micología Clínica y I Jornada de Parasitología Clínica
dc.type
Congreso
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