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dc.contributor.author
Metz, Sebastián Darío
dc.contributor.author
Huber, Maria Paula
dc.contributor.author
Mateus Barros, Erick
dc.contributor.author
Junger, Pedro C.
dc.contributor.author
de Melo, Michaela
dc.contributor.author
Bagatini, Inessa Lacativa
dc.contributor.author
Izaguirre, Irina
dc.contributor.author
Câmara dos Reis, Mariana
dc.contributor.author
Llames, Maria Eugenia del Rosario
dc.contributor.author
Accattatis, Victoria
dc.contributor.author
Quiroga, María Victoria
dc.contributor.author
Devercelli, Melina
dc.contributor.author
Schiaffino, María Romina
dc.contributor.author
Niño García, Juan Pablo
dc.contributor.author
Bastidas Navarro, Marcela Alejandra
dc.contributor.author
Modenutti, Beatriz Estela
dc.contributor.author
Vieira, Helena
dc.contributor.author
Saraceno, Martín
dc.contributor.author
Sabio y García, Carmen Alejandra
dc.contributor.author
Pereira, Emiliano
dc.contributor.author
González Revello, Alvaro
dc.contributor.author
Piccini, Claudia
dc.contributor.author
Unrein, Fernando
dc.contributor.author
Alonso, Cecilia
dc.contributor.author
Sarmento, Hugo
dc.date.available
2023-02-16T17:49:17Z
dc.date.issued
2022-12
dc.identifier.citation
Metz, Sebastián Darío; Huber, Maria Paula; Mateus Barros, Erick; Junger, Pedro C.; de Melo, Michaela; et al.; A georeferenced rRNA amplicon database of aquatic microbiomes from South America; Nature Research; Scientific Data; 9; 1; 12-2022; 1-12
dc.identifier.issn
2052-4463
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/188294
dc.description.abstract
The biogeography of bacterial communities is a key topic in Microbial Ecology. Regarding continental water, most studies are carried out in the northern hemisphere, leaving a gap on microorganism’s diversity patterns on a global scale. South America harbours approximately one third of the world’s total freshwater resources, and is one of these understudied regions. To fill this gap, we compiled 16S rRNA amplicon sequencing data of microbial communities across South America continental water ecosystems, presenting the first database µSudAqua[db]. The database contains over 866 georeferenced samples from 9 different ecoregions with contextual environmental information. For its integration and validation we constructed a curated database (µSudAqua[db.sp]) using samples sequenced by Illumina MiSeq platform with commonly used prokaryote universal primers. This comprised ~60% of the total georeferenced samples of the µSudAqua[db]. This compilation was carried out in the scope of the µSudAqua collaborative network and represents one of the most complete databases of continental water microbial communities from South America.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Nature Research
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
rRNA AMPLICON DATABASE
dc.subject
AQUATIC MICROBIOMES
dc.subject
SOUTH AMERICA
dc.subject.classification
Biología Marina, Limnología
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
A georeferenced rRNA amplicon database of aquatic microbiomes from South America
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2023-02-09T15:15:03Z
dc.journal.volume
9
dc.journal.number
1
dc.journal.pagination
1-12
dc.journal.pais
Reino Unido
dc.description.fil
Fil: Metz, Sebastián Darío. Universidad Nacional de San Martin. Instituto Tecnologico de Chascomus. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - la Plata. Instituto Tecnologico de Chascomus.; Argentina
dc.description.fil
Fil: Huber, Maria Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto Nacional de Limnología. Universidad Nacional del Litoral. Instituto Nacional de Limnología; Argentina
dc.description.fil
Fil: Mateus Barros, Erick. Universidade Federal do São Carlos; Brasil
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Fil: Junger, Pedro C.. Universidade Federal do São Carlos; Brasil
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Fil: de Melo, Michaela. Universidade Federal do São Carlos; Brasil
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Fil: Bagatini, Inessa Lacativa. Universidade Federal do São Carlos; Brasil
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Fil: Izaguirre, Irina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
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Fil: Câmara dos Reis, Mariana. Universidade Federal do São Carlos; Brasil
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Fil: Llames, Maria Eugenia del Rosario. Universidad Nacional de San Martin. Instituto Tecnologico de Chascomus. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - la Plata. Instituto Tecnologico de Chascomus.; Argentina
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Fil: Accattatis, Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto Nacional de Limnología. Universidad Nacional del Litoral. Instituto Nacional de Limnología; Argentina
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Fil: Quiroga, María Victoria. Universidad Nacional de San Martin. Instituto Tecnologico de Chascomus. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - la Plata. Instituto Tecnologico de Chascomus.; Argentina
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Fil: Devercelli, Melina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto Nacional de Limnología. Universidad Nacional del Litoral. Instituto Nacional de Limnología; Argentina
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Fil: Schiaffino, María Romina. Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
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Fil: Niño García, Juan Pablo. Universidad de Antioquia; Colombia
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Fil: Bastidas Navarro, Marcela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Medioambiente. Universidad Nacional del Comahue. Centro Regional Universidad Bariloche. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Medioambiente; Argentina
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Fil: Modenutti, Beatriz Estela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Medioambiente. Universidad Nacional del Comahue. Centro Regional Universidad Bariloche. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Medioambiente; Argentina
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Fil: Vieira, Helena. Universidade Federal do São Carlos; Brasil
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Fil: Saraceno, Martín. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
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Fil: Sabio y García, Carmen Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
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Fil: Pereira, Emiliano. Universidad de la Republica. Centro Universitario Regional del Este.; Uruguay
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Fil: González Revello, Alvaro. Instituto de Investigaciones Biológicas "Clemente Estable"; Uruguay
dc.description.fil
Fil: Piccini, Claudia. Instituto de Investigaciones Biológicas "Clemente Estable"; Uruguay
dc.description.fil
Fil: Unrein, Fernando. Universidad Nacional de San Martin. Instituto Tecnologico de Chascomus. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - la Plata. Instituto Tecnologico de Chascomus.; Argentina
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Fil: Alonso, Cecilia. Universidad de la Republica. Centro Universitario Regional del Este.; Uruguay
dc.description.fil
Fil: Sarmento, Hugo. Universidade Federal do São Carlos; Brasil
dc.journal.title
Scientific Data
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.nature.com/articles/s41597-022-01665-z
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1038/s41597-022-01665-z
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