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dc.contributor.author
Masone, Diego Fernando
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dc.date.available
2022-10-25T18:25:39Z
dc.date.issued
2021-12
dc.identifier.citation
Masone, Diego Fernando; Computational methods for biological problems: membrane proteins promenades; Sociedad Argentina de Bioingeniería; Revista Argentina de Bioingeniería; 25; 1; 12-2021; 3-15
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/174824
dc.description.abstract
In this work, we discuss the computational techniques of molecular dynamics and docking as essential tools in the study of the interactions between proteins and membranes. We focus on the cellular mechanisms of the membrane pore and the fusion pore, used by the cell to communicate with its exterior. We look at the cases of two proteins of interest: dynamin and alpha-synuclein, and describe their possible role in membrane events such as fusion, fission, and poration. Finally, we describe some of the most widely used docking and molecular dynamics softwares applied to biological protein and membrane systems.
dc.description.abstract
En este trabajo, comentamos las tecnicas computacionales de dinámica molecular y docking como herramientas esenciales en el estudio de las interacciones entre proteínas y membranas. Nos centramos en los mecanismos celulares del poro de membrana y el poro de fusion, utilizados por la célula para comunicarse con su exterior. Vemos los casos de dos proteínas de interes: la dinamina y alfa-sinucleína, y describimos su posible rol en eventos de membrana como la fusion, la fisión y la poración. Por último, describimos algunos de los softwares más comunmente utilizados en docking y en dinámica molecular aplicados a sistemas biológicos de proteínas y membranas.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
spa
dc.publisher
Sociedad Argentina de Bioingeniería
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
PROTEÍNAS
dc.subject
MEMBRANAS
dc.subject
DINÁMICA MOLECULAR
dc.subject
VARIABLES COLECTIVAS
dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Computational methods for biological problems: membrane proteins promenades
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2022-09-22T00:26:54Z
dc.identifier.eissn
2591-376X
dc.journal.volume
25
dc.journal.number
1
dc.journal.pagination
3-15
dc.journal.pais
Argentina
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dc.journal.ciudad
Mar del Plata
dc.description.fil
Fil: Masone, Diego Fernando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Histología y Embriología de Mendoza Dr. Mario H. Burgos; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ingeniería; Argentina
dc.journal.title
Revista Argentina de Bioingeniería
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://revista.sabi.org.ar/index.php/revista/article/view/428
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