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Artículo

Computational methods for biological problems: membrane proteins promenades

Masone, Diego FernandoIcon
Fecha de publicación: 12/2021
Editorial: Sociedad Argentina de Bioingeniería
Revista: Revista Argentina de Bioingeniería
e-ISSN: 2591-376X
Idioma: Español
Tipo de recurso: Artículo publicado
Clasificación temática:
Bioquímica y Biología Molecular

Resumen

 
In this work, we discuss the computational techniques of molecular dynamics and docking as essential tools in the study of the interactions between proteins and membranes. We focus on the cellular mechanisms of the membrane pore and the fusion pore, used by the cell to communicate with its exterior. We look at the cases of two proteins of interest: dynamin and alpha-synuclein, and describe their possible role in membrane events such as fusion, fission, and poration. Finally, we describe some of the most widely used docking and molecular dynamics softwares applied to biological protein and membrane systems.
 
En este trabajo, comentamos las tecnicas computacionales de dinámica molecular y docking como herramientas esenciales en el estudio de las interacciones entre proteínas y membranas. Nos centramos en los mecanismos celulares del poro de membrana y el poro de fusion, utilizados por la célula para comunicarse con su exterior. Vemos los casos de dos proteínas de interes: la dinamina y alfa-sinucleína, y describimos su posible rol en eventos de membrana como la fusion, la fisión y la poración. Por último, describimos algunos de los softwares más comunmente utilizados en docking y en dinámica molecular aplicados a sistemas biológicos de proteínas y membranas.
 
Palabras clave: PROTEÍNAS , MEMBRANAS , DINÁMICA MOLECULAR , VARIABLES COLECTIVAS
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info:eu-repo/semantics/openAccess Excepto donde se diga explícitamente, este item se publica bajo la siguiente descripción: Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 2.5 Unported (CC BY-NC-SA 2.5)
Identificadores
URI: http://hdl.handle.net/11336/174824
URL: http://revista.sabi.org.ar/index.php/revista/article/view/428
Colecciones
Articulos(IHEM)
Articulos de INST. HISTOLOGIA Y EMBRIOLOGIA DE MEND DR.M.BURGOS
Citación
Masone, Diego Fernando; Computational methods for biological problems: membrane proteins promenades; Sociedad Argentina de Bioingeniería; Revista Argentina de Bioingeniería; 25; 1; 12-2021; 3-15
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